高亲和力抗eGFP纳米抗体的筛选与应用

收稿日期:2020G10G25.
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31471648
).作者简介:刘晓芳(1991-),女,硕士生.∗通信作者:付金衡(1970-),男,副教授.E Gm a i l :f u j i n h e n g
@n c u .e d u .c n .㊀㊀文章编号:1006G0464(2021)01G0034G07
高亲和力抗e G F P 纳米抗体的筛选与应用
刘晓芳1a ,b ,刘㊀贝1a ,b ,周方月b ,黄云祥1a ,b ,钟引凤1a ,b
,张茹云b ,梁宇芳b ,王㊀丹2∗,付金衡b ∗
(1.南昌大学a .生命科学学院,江西南昌㊀330031;b .中德联合研究院,江西南昌㊀330047;
2.江西农业大学,江西南昌㊀330045
)摘㊀要:将增强型绿荧光蛋白(E n h a n c e dG r e e nF l u o r e s c e n tP r o t e i n ,e G F P )免疫
羊驼后构建纳米抗体免疫库,固相淘选e G F P 纳米抗体;构建E .c o l i R o s e t t a 表达载体,诱导表达纳米抗体,并鉴定其结合活性及特异性;辣根过氧化物酶(H o r s e r a d i s h p e r o x i d a s e ,H R P )
标纳米抗体,确定其工作浓度及稳定性;将纳米抗体与纳米磁珠偶联应用于免疫沉淀B 13GE G F P 融合蛋白.四免后抗血清滴度超过1.28ˑ106,获得库容量为1.85ˑ108
c f u 的抗e G F P 纳米抗
噬菌体展示文库;原核表达10种独特基因序列的纳米抗体,均为可溶性表达;采用F o r t e B i oO c t e t 确定出纳米抗
体4-28与e G F P 的亲和常数(K D )最高,达到9.67ˑ10-11
M ;纳米抗体4-28与e G F P ㊁绿荧光蛋白(G r e e nF l u o G
r e s c e n tP r o t e i n ,G F P )特异性结合;H R P 标记纳米抗体4-28检测范围是1 10000~1 25000(浓度100~40n g  m L -1),比市场上现有的检测二抗(稀释范围1 5000~1 20000)灵敏度更高;纳米抗体4-28偶联羧基化纳米磁珠,免疫沉淀B 13-e G F P 融合蛋白,实现了简单快速分离目的蛋白B 13-e G F P .关键词:纳米抗体;e G F P ;噬菌体展示;E L I S
A ;I P 中图分类号:Q 819㊀㊀㊀㊀文献标志码:A
S c r e e n i n g a n da p p l i c a t i o no f h i g ha f f i n i t y e
G F Pn a n o b o d i e s L I U X i a o f a n g 1a ,b ,L I U B e i 1a ,b ,Z HO U F a n g y u e b ,HU A N G Y u n x i a n g 1a ,b
,
Z HO N G Y i n f e n g 1a ,b ,Z H A N G R u y u n b ,L I A N G Y u f a n g b ,WA N G D a n 2,F UJ i n h e n g
b ∗
(1a .I n s t i t u t e o fL i f eS c i e n c e s ,N a n c h a n g U n i v e r s i t y ,N a n c h a n g 3
30031,C h i n a ;b .S i n o GG e r m a n y J o i n tR e s e a r c h I n s t i t u t e ,N a n c h a n g U n i v e r s i t y ,N a n c h a n g 3
30047,C h i n a ;2.J i a n g x iA g r i c u l t u r a lU n i v e r s i t y ,N a n c h a n g 3
30045,C h i n a )A b s t r a c t :T h e p e r i p h e r a l b l o o d o f e G F P i mm u n i z e d a l p a c aw a s u s e d t o c o n s t r u c t a n a n o b o d y
i mm u n e l i b r a r Gy ,a n d t h e e G F Pn a n o b o d y w a s s o l i d Gp h a s e p a n n e d .T h e E .c o l i R o s e t t ae x p
r e s s i o nv e c t o rw a s c o n s t r u c t e d a n de x p r e s s e dn a n o b o d y .T h eb i n d i n g a c t i v i t y a n d s p e c i f i c i t y o f n a n o b o d y w e r e i d e n t i f i e d .T h ew o r k i n g c o n Gc e n t r a t i o na n d s t a b i l i t y o f t h e e n z y m e Gl a b e l e dn a n o b o d y w a s v e r i f i e d a f t e rH R Pe n z y m e Gl a b e l e dn a n o b o d y
.T h en a n o b o d y a n dn a n o m a g n e t i cb e a d sw e r e c o u p l e d t oo b t a i nt h eB 13GE G F Pf u s i o n p r o t e i nb y i
mm u n o Gp r e c i p i t a t i o n .A f t e r f o u r i mm u n i z a t i o n s ,t h e a n t i s e r u mt i t e r e x c e e d e d 1.28ˑ106
a n d t h e e G F Pn a n o
b o d y l
i Gb r a r y w i t ha s t o r a g e c a p a c i t y o f 1.85ˑ108c f uw a s o b t a i n e d .N a n o b o d i e s o f t e nu n i q u e g e n e s e q
u e n c e sw e r e e x p r e s s e d i n p r o k a r y o t i c c e l l s ,a n d t h e y w e r e a l l s o l u b l e i n t r a c e l l u l a r l y
.N a n o b o d i e s 4-28h a v e t h e b e s t a f Gf i n i t y c o n s t a n t (K D )w i t he G F Pb y F o r t e B i oO c t e t ,r e a c h i n g 9.67ˑ10-11
M ;N a n o b o d y 4-28s p e c i f i c a l l y
b i n d sw i t h e G F Pa n dG F P .T h e d e t e
c t i o n r a n g e o f t h eH R Pe n z y m e Gl a b e l e dn a n o b o
d y 4-2
8w a s 1 10000~1 25000(100~40n g  m L -1),w h i c h i sh i g h e r t h a ne x i s t i n g d e t e c t i o ns e c o n d a r y a
n t i b o d i e so nt h e m a r k e t (d i l u t i o n r a n g e 1 5000~1 20000).N a n o b o d y 4-28w a s c o u p l e dw i t hc a r b o x y l a t e d m a g
n e t i c n a n o b e a d s t o i mm u n o p r e c i p i t a t e t h eB 13Ge G F Pf u s i o n p r o t e i n ,l e a d i n g t oas i m p l ea n dr a p i ds e p
a r a t i o no f t h e t a r g
e t p r o t e i nB 13Ge G F P .K e y w
o r d s :N a n o b o d y ;e G F P ;P h a g e d i s p l a y ;E L I S A ;I P 第45卷第1期2021年2月
㊀㊀㊀
㊀㊀㊀
南昌大学学报(理科版)
J o u r n a l o fN a n c h a n g U n i v e r s i t y
(N a t u r a l S c i e n c e )V o l .45N o .1
F e b .2021
㊀㊀S h i m o m u r e等首次分离出的G F P[1]具有β桶和αG螺旋使其性质稳定[2],研究者常把它作为一种标签分子应用于抗体检测[3-4]㊁单分子荧光成像[5]㊁细胞内定位[6-7]等领域[8].G F P/e G F P作为最常用的工具蛋白,在生命科学研究中具有很高的研究与应用价值,抗G F P/e G F P纳米抗体应运发展.与传统抗体相比,具有小体积,15K D a分子质量;耐酸耐热较高稳定性㊁穿透力强㊁易于基因工程改造及表达㊁亲和性高等优点[9-10]的纳米抗体被广大科学研究者应用于各领域[11],例如在发育生物学中的有机体和细胞培养系统中[12-13],作为稳定生物学中构象状态的结晶伴侣[14,15];作为酶的活性调节剂或抑制剂[16,17];作为生物化学分析的免疫组化试剂[18]或作为 二抗 检测抗鼠抗I g的免疫印迹和免疫荧光[19]等.特异性结合G F P/e G F P的抗G F P/e G F P纳米抗体在亚细胞定位[20]㊁细胞内信号通路研究和活细胞成像[21-22]以及靶向纳米材料[22]等方面被广泛应用.但对高亲和力的抗G F P/e G F P纳米抗体的研究鲜少报道.
ccenter本研究以e G F P蛋白免疫羊驼皮下部位,构建抗e G F P纳米抗体噬菌体展示文库;经过四轮淘选获得能与e G F P结合的纳米抗体,通过基因克隆技术在大肠杆菌R o s e t t a中表达,获得了高亲和力的纳米抗体4-28,H R P酶标纳米抗体4-28作为检测 二抗 ,简化E L I S A实验操作,纳米抗体4-28偶联纳米磁珠,免疫沉淀B13Ge G F P融合蛋白,为抗e G F P纳米抗体的应用奠定基础.
1㊀材料与方法
1.1㊀实验材料与试剂
led数码管显示屏M13辅助噬菌体㊁噬菌粒载体p C o m b3X S S㊁E.c o l i T G1㊁E.c o l i D H5α㊁R o s e t t a(D E3)㊁p E T-25b (+)载体均由本实验室保存;弗氏佐剂购自S i g m a 公司;质粒提取试剂盒㊁D N A纯化试剂盒㊁割胶纯化试剂盒购自天根生物有限公司;T a q酶㊁核酸内切酶㊁D N A连接酶等均购自T a K a R a公司;M13B a cGt e r i o p h a g eA n t i b o d y(H R P)购自北京义翘神州科技有限公司;H R P A n t iH i sGT a g M o u s e M o n o c l o n a l A n t i b o d y购自北京康为世纪生物科技有限公司;人外周血淋巴分离液㊁所需引物购自生工生物工程(上海)股份有限公司.
巢式P C R扩增V HH基因,所需引物分别为:
V HGL D:C T T G G T G G TC C T G G CT G C
C H2GR:G G T A C G T G C T G T T G A A C T G T TC C
V HH1:C A T G C C A T G A C T G T G G C C C A GGG C G G C C C A G K T G C A G C T C G T G G A G T C
V HH2:C A T G C C A T G A C T C G C G G C C G G CGC T G G C C A T G G G G G T C T T C G C T G T G G T G C G V HH3:C A T G C C A T G A C T C G C G G C C G G CGC T G G C C G T C T T G T G G T T T T G G T G T C T T G G G 1.2㊀实验仪器与设备
台式高速冷冻离心机㊁酶标仪㊁N a n o D r o p购自T h e r m o公司;超声波细胞粉碎机购自宁波新芝公司;凝胶成像系统购自上海天能科技有限公司;电泳仪购自B I OGR A D公司;恒温培养箱和恒温摇床购自上海一恒科技公司;P C R仪购自艾本德公司;
D Y YGI I I I稳压电泳购自为北京六一仪器厂.1.3㊀方法
1.3.1㊀噬菌体展示文库的构建
分别取免疫前静脉血作阴性组和每次免疫后静脉血,监测血清效价;取e G F P四免羊驼后的静脉血50m L提取总R N A,然后反转录成c D N A,两步巢式P C R进行扩增V HH基因,将纯化后的V HH基因克隆至M13噬菌粒载体p C o m b3X S S上,电转至E.c o l i T G1感受态细胞中,得到噬菌体文库.1.3.2㊀抗e G F P纳米抗体的淘选与鉴定
采用固相亲和淘选的方法,以e G F P为靶标从噬菌体文库中淘选特异性结合e G F P的纳米抗体.淘选策略如下,1)逐轮降低抗原包被在酶标板孔中的浓度:100~1μg m L-1;2)每轮均投入纳米抗体文
库:1.0ˑ1012c f u,3)逐轮降低抗体库与抗原结合时间:第1轮结合60m i n,第2轮结合30m i n,第3~4轮结合15m i n;4)逐轮增加洗涤次数:第一轮分别用磷酸盐吐温缓冲液(P B S T)和磷酸盐缓冲液(P B S)各洗涤5次,第二㊁三㊁四轮各洗涤10,15,20次;5)噬菌体洗脱:先采用p H4.0的甘氨酸-盐酸洗脱掉亲和力较低的噬菌体,然后再采用p H2.2的甘氨酸-盐酸洗脱得到特异性噬菌体,每一轮的洗脱条件一致.采用间接p h a g eGE L I S A鉴定从第3,4轮测定洗脱物滴度的平板上各随机挑取的45个单菌落,确定阳性克隆.
1.3.3㊀抗e G F P纳米抗体的原核表达与纯化1)P C R扩增出阳性噬菌体克隆子片段;N c oI 和N o t I分别酶切4-28基因与p E T-25b(+),将纯化的目的片段与表达载体用T4D N A连接酶16ħ过夜连接,连接产物转化至R o s e t t a(D E3)感受态中;菌落P C R验证随机挑取的10个克隆子并测序.
53
第1期㊀㊀㊀㊀㊀刘晓芳等:高亲和力抗e G F P纳米抗体的筛选与应用
2)1%接种量转接至100m L培养基,37ħ220r m i n-1震荡培养至O D600ʈ0.6-0.8时加入终浓度为0.1mm o l L-1I P T G,30ħ220r m i n-1震荡培养6h;收集培养物;P B S重悬离心后的菌体,将超声破碎后的上清经N iGN T A R e s i n纯化,S D SGP A G E分析纯化结果.
1.3.4㊀E L I S A鉴定抗e G F P纳米抗体活性及特异性
1)将1μg m L-1的e G F P4ħ过夜包被; P B S T甩洗3次,4%脱脂乳37ħ封闭1h;P B S T甩洗3次,100μL 孔-1加入稀释至不同浓度纯化后的纳米抗体4-28,37ħ孵育30m i n;P B S T洗板3次,加入二抗,37ħ孵育30m i n;P B S T甩洗拍干6次,加入预热的T M B单组份显液,37ħ孵育8-10m i n,最后加入浓H2S O4终止液终止反应,酶标仪测O D450.
2)分别将e G F P,G F P,黄荧光蛋白(Y F P),牛血清白蛋白(B S A),卵清蛋白(O V A)稀释至1μg  m L-1包被于酶标板中,按照1)的实验方法进行操作,测O D450.
1.3.5㊀亲和力测定
采用O C T E T系统生物传感器测定纳米抗体4-28与e G F P的亲和力,将200μL生物素化的e GGF P固定在链酶亲和素的探针上,洗涤,加入200μL 纳米抗体,使抗原抗体结合,结束后进行解离;最后通过软件进行拟合运算计算出动力学参数.1.3.6㊀H R P偶联纳米抗体4-28及工作浓度和稳定性鉴定
1)采用过碘酸钠法将H R P偶联抗e G F P纳米抗体4-28,向0.3m g的溶于H A cGN a A c㊁(p H5.6)溶液中H R P中加入N a I O4,使其H R P表面的糖分子氧化成醛基,1mm o l L-1醋酸钠
缓冲液(p H4.4)每隔4h透析两次后,加入150μg的纳米抗体(4-28)4ħ反应4h,加入C H3B H N a(5m o l L-1)反应后用乙醇胺封闭,加入终饱和度45%的硫酸铵粉末,离心取沉淀即为偶联物.2)直接E L I S A鉴定其工作浓度及稳定性,分别包被e G F P和B S A/O V A1μg m L-1,封闭后加入稀释不同倍数的H R P偶联纳米抗体4-28,加入预热的T M B单组份显液反应8-10m i n后终止,测O D450值.分别将放置-20ħ2个月和6个月的H R P偶联纳米抗体4-28直接E L I S A(同上)的实验操作验证其稳定性.
1.3.7㊀B13GE G F P融合蛋白的原核表达与纯化
分别将e G F P P C R产物和p E T-25bGB13经H i n d I I I㊁N h e I双酶切后T4D N A连接酶连接,钙转至R o s e t t a(D E3)感受态中;随机挑选5个克隆子菌落P C R后测序.诱导表达与纯化参照1.3.3操作.
1.3.8㊀纳米抗体4-28偶联纳米磁珠及免疫沉淀B13GE G F P融合蛋白
1)羧基化的纳米磁珠偶联高亲和力的纳米抗体4-28,在磁力架的作用下,将磁珠固定在离心管壁上,活化3~4次,加入活化缓冲液㊁E D C和S u l f oGN H S,室温孵育15m i n;磁珠被固定在管壁上后吸弃上清,加入纳米抗体4-28适时反应后4ħ过夜偶联;重复封闭两次,加入保存液4ħ保存备用.2)根据抗原抗体反应原理,免疫沉淀B13Ge GGF P融合蛋白.将含有p E T-25bGB13
Ge G F P质粒的R o s e t t a细胞诱导表达后超声破碎,加入抗e G F P 纳米抗体4-28偶联磁珠,并用碳酸盐缓冲液(C B S)洗涤磁珠沉淀物3次,去除未结合的杂蛋白, S D SGP A G E鉴定上清液和磁珠沉淀物.
2㊀结果与讨论
2.1㊀噬菌体展示文库的构建
四免后的羊驼抗血清滴度超过1.28ˑ106(图1a).采用两步巢式P C R扩增V HH基因,第一步扩增得到了约750b p的片段(图1b),第二步扩增得到了约500b p的目的基因(图1c);将V HH基因克隆至M13噬菌粒载体p C o m b3X S S后转化至E.c o l i T G1,收获到库容量为1.85ˑ108c f u纳米抗体原始库,经M I3K O7救援后得到滴度为4ˑ1013c f u  m L-1的噬菌体展示文库.
2.2㊀抗e G F P纳米抗体的淘选与鉴定
抗体的亲和常数K D=K o f f(解离常数)/K o n (结合常数),K D值越小,抗体的亲和力越高.本研究拟获得高亲和力的抗e G F P纳米抗体,因此在原有的基础上适当调整了淘选策略.通过逐轮降低抗
2.5
2.0
1.5
1.0
0.5
1:2
1:4
1:8
1:16
1:32
1:64
1:1281:1
阴性血清
三免血清
四免血清
O
D4
5
稀释比/W
(a)
63 南昌大学学报(理科版)2021年㊀
750bp
(b
)500bp
(c
)㊀㊀泳道M :D N A m a r k e rD L 2000;泳道1:巢式P C R 第一步扩增产物;泳道2:巢式P C R 第二步扩增产物(V HH 1和
V HH 2引物对扩增)泳道3:巢式P C R 第二步扩增产物(V HH 1和V HH 3引物对扩增)
.图1㊀血清效价(a )及巢式P C R 扩增产物电泳图(b ㊁c )原包被浓度㊁逐轮减少抗体文库与抗原的结合时间,以期保留K o n 值较大的纳米抗体;
通过逐轮增加洗涤次数㊁并在洗脱前用p H 4.0的甘氨酸盐酸除去
K o f f 相对较大的纳米抗体,淘选数据(表1)中表明抗e G F P 特异性纳米抗体有效富集(
富集度为52.17
);由于第三四轮淘选时,包被抗原的浓度依次从20降低到5再到1μg  m L -1以及逐轮增加淘选条件严格程度,使第三轮和第四轮的回收率和富集度没有明显增加,甚至出现了一定程度的降低(富集度小于1),该结果表明,本研究采用的淘选策略有效的富集了高亲和力纳米抗体,除掉了低亲和力纳米抗体.采用间接E L I S A 鉴定第3㊁4轮克隆子,结果如图2㊁3所示,阳性率达到了95.56%和97.78%;
2采用D N A s t a r 软件进行多序列对比分析,得到了10
表1㊀淘选结果
淘选
轮次噬菌体投入量/c f u
噬菌体洗脱量/
(c f u  m L -1)
回收率富集度11.0ˑ1012
1.38ˑ1071.38ˑ10-5
21.0ˑ10
127.2ˑ10
87.2ˑ10-4
52.1731.0ˑ10
121.98ˑ1081.98ˑ10-40.2754
11.0ˑ10
12
2.23ˑ10
2.23ˑ10-4
1.13
种纳米抗体序列;将这10种纳米抗体的噬菌体分别稀释至同一浓度,采用E L I S A 测试其结合活性,结果如图4所示,克隆
内嵌模组4-28的O D 450最高.
O D 450
2
1
N C :阴性对照;B K :
空白对照.图2㊀间接E L I S A 鉴定阳性克隆
平行流冷凝器
O D 450
21
N C :阴性对照;B K :
空白对照.图3㊀间接E L I S A 鉴定阳性克隆
2.01.51.00.50
1:6401:3201:1601:801:401:201:11
:1280O D 450
3-2
3-63-333-353-44
3-454-184-284-33
4-38
稀释比
图4㊀E L I S A 测定阳性噬菌体克隆
2.3㊀原核表达载体的构建与表达
按照1.3.3的方法构建原核表达载体,菌落P C R 验证如图5所示,将750b p 处条带测序且测序结果显示序列正确,表达载体构建成功.将构建好
的表达载体转化至大肠杆菌R o s e t t a 感受态中,I P T G
750bp
㊀㊀泳道M :D N A m a r k e rD L 2000;泳道1-10:
随机挑取的转化子.图5㊀转化子菌落P C R 验证
73 第1期㊀㊀㊀㊀㊀
刘晓芳等:高亲和力抗e G F P 纳米抗体的筛选与应用
(0.1mm o l  L -1)30ħ诱导表达6h 后超声破碎,破碎上清经N i GN T A R e s i n 纯化后得到与预期大小相符的20k D a 左右的纳米抗体4-28蛋白(
图6),B C A 定量蛋白浓度为1.2m g
m L -1.20KDa
97.266.444.329.020.1
14.3
KDa ㊀㊀M :蛋白m a r k e r ;泳道1:诱导前菌体总蛋白;泳道2:诱导后菌体总蛋白;泳道3:破碎上清;泳道4:破碎沉淀;泳道
5:镍柱纯化流穿液;泳道6 20mm o l  L -1咪唑洗涤液;泳道7 100mm o l
L -1咪唑洗脱液.图6㊀4-28在E .c o l i B L 21(D E 3)中诱导表达的S D S GP A G E 2.4㊀抗e G F P 纳米抗体的结合活性及特异性分析
采用E L I S A 分析的结合活性,如图7所示,随着抗e G F P 纳米抗体4-28浓度的增加,其O D 450值逐渐升高并趋于稳定,表明纳米抗体4-28结合活性良好;将e G F P /G F P /Y F P /B S A /O V A 稀释至相
同浓度包被后,加入相同浓度的纳米抗体,测
O D 450,如图8所示,该抗体和e G F P ㊁G F P 蛋白结合,和Y F P ㊁B S A ㊁O V
A 结合很弱或不结合,
表明纳2.21.8
1.41.00.6
O D 450
1
0.1
10
抗体浓度/(μ
g  m L -1
)(a
)  2.01.5
1.00.50
O D 450
GFP eGFP YFP OVA
BSA 抗原
(b
)㊀㊀e G F P :增强型绿荧光蛋白;G F P :
绿荧光蛋白;Y F P :黄荧光蛋白;B S A :牛血清白蛋白;O V A :
卵清蛋白.图7㊀纳米抗体结合活性(a )和特异性验证(b
)米抗体4-28特异性良好.
2.5㊀亲和力测定分析
采用F o r t e B i oO c t e t 研究纳米抗体与e G F P 的亲和力.结果如图8所示,纳米抗体4-28的结合
常数(K o n )和解离常数(K o f f )
分别为2.74ˑ105
M -1和2.65ˑ10-5M -1s -1,则K D 为9.67ˑ10-11
M .表2为10种独特序列的抗e G F P 纳米抗体的亲和力
常数(K D ),其中3-2和3-45未检测到信号.纳米抗体作为单价抗体,只有一个结构域,其亲和力与传统单克隆抗体相比较低,已有文献报道的纳米抗体亲和力常数多在1μM-1n M .本研究获得的纳米抗体4-28亲和力相对较高,表明实验中采用的淘选策略是正确的.
1.00.80.60.40.20
B q i n d i n g /n m Concentration/nm
miad530100
25
Sensor Fit
400
2000T /s
图8㊀4-28与e G F P 动力学结合曲线
表2㊀10种纳米抗体亲和力常数
抗体编号
3-63-333-443-454-184-28
4-324-383-2
3-35K D (n M )
5.35
0.59
5.67
0.12
4.79
0.09670.449
0.319
2.6㊀H R P 标记纳米抗体4-28工作浓度及稳定性
鉴定
如图9所示,4ħ放置一周后,
抗体活性下降,-20ħ放置,
时间长短对抗体活性无影响,由图9可知该酶标抗体的使用稀释范围为1 10000~1
25000(浓度100~40n g
m L -1),相比于市场上现有的检测二抗(稀释范围1 5000~1 20000)其灵敏度更高.
27.5g bt
2.7㊀融合蛋白的诱导表达及免疫沉淀
表达后的B 13Ge G F P 融合蛋白经N i 柱纯化时,仅用100mm o l
L -1咪唑洗脱目的蛋白,结果如图10a 所示,获得分子量为45k D a 左右的胞内可溶性
83 南昌大学学报(理科版)
2021年㊀

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