Affymetrix表达谱芯片

Affymetrix表达谱芯片
Affymetrix 人表达谱芯片服务
芯片名称:Affymetrix GeneChip® Human Transcriptome Array 2.0 NEW!芯片介绍:Affymetrix 最新开发此款芯片为您提供支持所有转录本异构体的全转录组分析。同时,针对
超过40,000个非编码转录本的探针设计,还可帮助您对非编码RNA进行分析。数据来源于RefSeq,En sembl,UCSC,MGC,nocode,lncRN db及Broad Institute, Human Body Map lincRNAs and TUCP catalog。
芯片名称:Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array
芯片介绍:此款芯片包含了47,000个转录本,代表了38,500个明确的人类基因。数据库来源于Gene
Bank、dbEST、RefSeq、UniGene database(Build 159 January 25 2003)、Washington Universit y EST trace repository、NCBI human genome assembly(Build 31)。
芯片名称:GeneChip Human Gene 2.0 ST Array
芯片介绍:Affymetrix 新一代全转录本芯片,一张芯片上可同时检测mRNA和lincRNA,在其上一代
1.0 ST Array的基础上内容进一步丰富并更新了数据库。全面覆盖转录组,可以同时检测>30,000个编码的转录本和>11,000个长链非编码转录本;探针设计最大程度覆盖所有外显子,可检测选择性拼接/转录本变体。每个转录本覆盖特异探针的数目中值达到21种,每种探针的长度为25bp,这意味着每个转录本将被检测的碱基数中值高达525个,高重复性,高灵敏度。数据来源于RefSeq,Ensembl,GenBan k,UCSC,LncRNA db,Broad Institute, Human Body Map lincRNAs and TUCP (transcripts o f uncertain coding potential) catalog。
芯片名称:GeneChip Human Exon 1.0ST Array
芯片介绍:Affymetrix全转录本表达谱芯片产品,约有4个探针来针对每个外显子,约有40个探针来
针对每个基因,覆盖经验性及预测的外显子序列,约1000000 个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。
芯片名称:GeneChip Human Gene 1.0 ST Array
芯片介绍:该表达谱芯片覆盖人全转录本,每个基因用大约25个探针来检测,检测28,869个功能明确的基因表达情况。数据来源于RefSeq,Ensembl,GenBank,UCSC。
芯片名称:PrimeView™Human Gene Expression Array
芯片介绍:基于UniGene 219和RefSeq 36版本设计探针,包含530,000个探针可以检测20,000多
个注释完好功能明确基因的36,000多个转录本,每个转录本采用9-11个探针进行检测。相对于偏重于功能注释完善的基因。
芯片名称:Almac Xcel™Array
芯片介绍:专门针对福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本设计及优化,针对97,000多个转录本的探针
组,70%内容与GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0芯片的内容相同。还有8%是未包含的经过验证的RefSeq更新信息,其余22%来自高质量的Almac 公司内部测序数据和验证过滤后的公开数据。
芯片名称:GeneChip Human Transcriptome and Splice Junction Array
芯片介绍:Affymetrix 新近推出的人类转录组和剪接体分析芯片(Human Transcriptome and Splice
Junction Array),又称GG-H芯片(Glue Grant Human Transcriptome Array,GG-H),是Affymet rix联合Stanford大学和NIH的Glue Grant项目,共同研发的一种基于全新设计理念的芯片。这种芯片针对人类转录组全方位检测的需要,分别对外显子和外显子连接区设计探针,可同时用于基因表达、替代性
剪接和编码区SNPs检测;另外,该芯片还收录了大量非编码RNA片段,可用于非编码RNA转录的检测。
Affymetrix 大鼠表达谱芯片服务
芯片名称:GeneChip® Rat Gene 2.0 ST Array
详细介绍:此款芯片覆盖全转录本,每个基因用大约22个探针来检测,对28,407个转录本进行检测,其中包含23,508个功能明确基因。数据来源于RefSeq Release,Ensembl Release 。
芯片名称:GeneChip® Rat Gene 1.0 ST Array
详细介绍:此款芯片覆盖全转录本,每个基因用大约22个探针来检测,检测17,061个转录本,其中包
含16,557个功能明确的基因。数据来源于RefSeq Release,Ensembl Release,GenBank,UCSC和RGSC。
芯片名称:GeneChip Rat Exon 1.0 ST Array
详细介绍:此款芯片不但可进行基因表达检测,还可以检测基因的可变剪切,很对每个外显子有四个
探针,针对每个基因将近有40个探针,约100万个探针,含850,000个外显子集。数据来源于Ensembl,EST 。
芯片名称:GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array
详细介绍:Affymetrix 大鼠(拉丁文:Rattus norvegicus)基因组230 2.0芯片包含有31,000个pr
obe sets,可分析30,000个转录本和变异体,代表28,000个大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbE ST, RefSeq等。
Affymetrix 小鼠表达谱芯片服务
芯片名称:GeneChip® Mouse Gene 2.0 ST Arrays
详细介绍:同时检测mRNA和LincRNA,涵盖了35,240个转录本,包含约2000条lincRNA转录本,其中包含26,515个功能明确基因。数据来源于RefSeq,Ensembl 和lncRNAdb。
芯片名称:GeneChip Mouse Gene 1.0 ST Array
芯片介绍:同时检测mRNA和LincRNA,涵盖了26,166个转录本,另外含8条lincRNA转录本,其中包含21,041个功能明确基因。数据来源于RefSeq,Enseml,GenBank和lncRNAdb。
芯片名称:GeneChip® Mouse Exon 1.0 ST Array
芯片介绍:包含超过450万个长度为25bp特异的寡核苷酸探针,构成了120万个探针集,含100万多个外显子集(4 Probe/外显子)、8万多个转录本集(含预测的可变剪切)。
芯片名称:GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array
芯片介绍:该款芯片涵盖了39,000个转录本,代表34,000个的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、
dbEST、RefSeq,The sequence clusters 在UniGene database (Build 107, June 2002)创建,并通过了Whitehead Institute for Genome Research (MGSC, April 2002)小鼠基因组进行了分析比较。
芯片名称:GeneChip Mouse Genome 430A 2.0 Array
芯片介绍:该款芯片代表约144,000个小鼠基因,涵盖GeneChip® Mouse Expression Array 43
0A上所有信息,序列信息来源于GeneBank、dbEST、RefSeq,The sequence clusters 在UniGene database (Build 107, June 2002)创建,并通过了Whitehead Institute for Genome Research (M GSC, April 2002)小鼠基因组进行了分析比较。
Affymetrix 线虫表达谱芯片服务
芯片名称:C. elegans Gene 1.0 ST Array
详细介绍:可用于线虫转录本表达的研究,可检测28,305个基因,每条序列有24个探针,数据来源W S231。
芯片名称:C. elegans Genome Array
详细介绍:线虫(拉丁文:Caenorhabditis elegans)是发育生物学和功能基因组学的模式生物之一
这款芯片涵盖了22,500个线虫的转录本。序列信息来源于Sanger Center database release(Decem ber,2000),GenBank release 121,并且Affymetrix 重新进行功能注释完善。
Affymetrix 果蝇表达谱芯片服务
芯片名称:GeneChip Drosophila Genome 2.0 Array 产品编号:AFF-900531
详细介绍:该芯片可用于研究果蝇(拉丁文:Drosophila melanogaster)转录本的基因表达。共包含
18,880个探针组,可用于分析超过18,500个转录本。序列来源于Flybase version 3.1,14个探针对代表每个序列的转录水平。
Affymetrix 鸡表达谱芯片服务
芯片名称:Chicken Gene 1.0 ST Array
详细介绍:该芯片可用于研究鸡转录本的基因表达。共包含439,582个探针,可用于分析18,214个转录本,每个转录本由24个探针组成的探针组来检测。序列信息来源于基因组galGal3。
芯片名称:GeneChip Chicken Genome Array
详细介绍:该款鸡基因组芯片用来研究33,457个鸡及病毒的转录本的基因表达。芯片全面覆盖32,77
3个转录本,可同时检测28,000个基因,同时包含689个探针组,检测来自17种禽流感病毒的684个转录本,每个转录本由11个探针组成的探针组来检测。序列信息来源于GenBank, UniGene (Build 1 8; 15 May 2004), and Ensembl (version 1, released May 2004)的共同部分。
Affymetrix 狗表达谱芯片服务
芯片名称:Canine Gene 1.0 ST Array
详细介绍:该芯片可用于研究犬(拉丁文:Canis familiaris)转录本的基因表达,共包含590,097个
探针,可用于分析27,681个转录本,每个转录本由24个探针组成的探针组来检测。序列来源于canFa m2基因组。
芯片名称:GeneChip Canine Genome 2.0 Array
详细介绍:犬(拉丁文:Canis familiaris)是人类疾病医学研究的重要模式生物。Affymetrix犬基因
组芯片2.0可使研究者同时研究18,000个家犬(C. familiaris)mRNA/EST-based transcripts转录本和超过20,000条非冗余预测基因。序列信息来源于家犬UniGene Build #11 (April, 2005), GenBan k mRNAs up to April 15, 2005, BROADD1 gene predictions from the boxer dog genome(EBI on May 9, 2005)。

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