根据中国微物菌种保藏委员会管理和组织条例的规定，为了加强医学微生物菌种(以下简称菌种)的保藏管理，特制定本管理办法。
第一条组织及任务
在卫生部领导下，在中国微生物菌种保藏委员会指导下，设下列医学微生物菌种保藏管理中心：
中国医学真菌菌种保藏管理中心：由中国医学科学院皮肤病防治研究所负责。
中国医学细菌菌种保藏管理中心：由卫生部药品生物制品检定所负责。
中国医学病毒菌种保藏管理中心：由中国预防医学中心病毒学研究所负责。 保藏管理中心的任务是；
(一)负责本门类微生物菌种的选择、收集、鉴定、保藏、交换和供应；
(二)开展菌种分类、鉴定及保藏管理的研究；
(三)组织学术交流和经验交流；
(四)办理国内外菌种交换；
(五)编制保管的菌种目录。
保藏管理中心下设专业实验室，承担全国性的业务工作。 专业实验室对其直接领导机构和保藏管理中心负责，并定期向管理中心汇报工作情况。其具体任务是：
(一)负责本专业有关微生物菌种的选择、收集、鉴定、保藏、交换和供应；
(二)承担本专业有关疑难菌种鉴定；
(三)开展有关菌种分类、鉴定、保藏的研究，包括新技术、新方法的研究和应用；
(四)办理对外交流和交换菌种。
各专业实验室科研技术人员的编制和经费由所属主管部门负责。
生物制品生产、检定用的菌种按“生物制品生产、检定用菌种、毒种管理规程”执行，统一由卫生部药品生物制品检定所办理。
第二条菌种的分类
菌种的分类根据其危险性决定(包括实验室感染的可能性，感染后发病的可能性，症状轻重及愈后情况，有无致命危险及有效的防止实验室感染方法，用一般的微生物操作方法能否防止实验室感染、我国有否此种菌种及曾否引起流行、人免疫力等情况)。依其危险程度的大小，我国的菌种分为四类。
一类：实验室感染的机会多，感染后发病的可能性大，症状重并能危及生命，缺乏有效的预防方法，以及传染性强，对人危害性大的烈性传染病，包括国内未发现或虽已发现，但无有效防治
方法的烈性传染病菌种。如：
天花病毒、黄热病毒(野毒株)、新疆出血热(克里米亚刚果出血热)病毒、东、西方马脑炎病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、拉沙热()病毒、马堡()病毒、埃波拉(01a)病毒、猴疤疹病毒(猴B病毒)；
粗球孢子菌、英膜组织胞浆菌、杜波氏组织胞浆菌。
二类：实验室感染机会较多、感染后的症状较重及危及生命，发病后不易及对人危害较大的传染病菌种。如：
土拉弗郎西丝氏菌、布氏菌、芽胞菌、肉毒梭菌、鼻疽假单胞菌、类鼻疽假单胞菌、麻风分枝杆菌、结核分枝杆菌。
狂犬病病毒(街毒)、森林脑炎病毒、流行性出血热病毒、国内尚未发现病人在国外引起脑脊髓炎及出血热的其它虫媒病毒、登革热病毒、甲、乙型肝炎病毒；
各种立克次体(包括斑疹伤寒、Q热)；
鹦鹅热、鸟疫衣原体、淋巴肉芽肿衣原体；
马纳青霉、北美芽生菌、付球孢子菌、新型隐球菌、巴西芽生菌、烟曲霉、着霉菌。
三类：仅具有一般危险性，能引起实验室感染的机会较少，一般的微生物学实验采用一般实验技术能控制感染或有对之有效的免疫预防方法的菌种。如：
脑膜炎奈瑟氏菌、肺炎双球菌、葡萄状球菌、链球菌、淋病奈瑟氏菌及其他致病性奈瑟氏菌、百日咳博德特氏菌、白喉棒杆菌及其它致病性棒杆菌、流感嗜血杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、致病性大肠埃希氏菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、空肠弯曲菌、酵米面黄杆菌、付溶血性弧菌、变形杆菌、李斯特氏菌、铜绿假单也泡菌、气肿疽梭菌、产气英膜梭菌、破伤风梭菌及其它致病梭菌；
钩端螺旋体、梅毒螺旋体、雅司螺旋体；
乙型脑炎病毒、脑心肌炎病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒以及未列入一、二类的其它虫媒病毒、新
必斯()病毒、滤泡性口炎病毒、流感病毒、付流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺炎病毒、麻疹病毒、脊髓灰质炎病毒、腺病毒、柯萨奇(A及B组)病毒，艾
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