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基于序列比对核函数预测信号肽及其断裂点位置实现方法[发明专利]

专利名称：基于序列比对核函数预测信号肽及其断裂点位置实现方法

专利类型：发明专利

发明人：刘惠，刘丹青，姚莉秀，杨杰

申请号：CN200610024271.6

申请日：20060302

公开号：CN1818916A

公开日：

20060816

专利内容由知识产权出版社提供

摘要：一种基于序列比对核函数预测信号肽及其断裂点位置实现方法，属于生物工程技术领域。本发明采用全局序列比对以解决所研究的氨基酸序列长度不一致的难题，并计算两氨基酸序列之间的统计相关性以表征两者之间的相似度，通过将相似度矩阵转换为非负定矩阵后经过空间转换得到新坐标，从而解决不满足非负定性条件的矩阵如何生成核矩阵的问题。对于新测定的氨基酸序列在新特征空间可预测其是否信号肽并判定其断裂点位置。本发明提高了以往预测信号肽的正确率以及断裂点的预测率，从而对于理解某些疾病的致病过程有极大促进作用，进而有助于开发有效的方案。

申请人：上海交通大学

地址：200240 上海市闵行区东川路800号

国籍：CN

代理机构：上海交达专利事务所

本文发布于:2024-09-24 02:34:00，感谢您对本站的认可！

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