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实验室呼吸道病毒与感染学组—肺部真菌病课题组2021年研究成果回顾
实验室呼吸道病毒与感染学组—肺部真菌病课题组是在钟南⼭院⼠和实验室领导的⽀持下,由叶枫教授( PI),李征途,占扬清,李少强等核⼼组员组建⽽成。本课题组主要从事肺部真菌病的临床诊治和发病机制研究(临床与基础相结合的转化研究)。临床⽅⾯,建⽴了全国肺部真菌病诊治协作组、华南地区肺部真菌病诊治中⼼,成功诊治了⼤量的隐球菌病、曲霉病、⽑霉病、肺孢⼦菌肺炎及马尔尼菲篮状菌病、暗⾊丝孢霉病等少见真菌病。通过患者,制定有效、安全的经济个体化诊疗⽅案,专科医师及护⼠的定期随访。科研⽅⾯,依托实验室,开展了肺部真菌病的分⼦流⾏病学、真菌感染的免疫学和抗真菌药物药理机制研究等。
在叶枫教授的带领下,课题组建⽴了 4⼤研究平台:病原测序平台、肺部真菌病⼤数据平台、肺部真菌感染与免疫研究平台、抗肺部真菌药物药效与机制研究平台。经过多年的努⼒,不但形成了以肺部真菌病为研究特⾊的研究平台,并实现了平台的转化应⽤研究。取得了⼀定的研究成果。 2021年获得 6项课题的资助,发表⾼⽔平学术论⽂ 16篇,申报发明专利 4项,获得授权 2项。 2021年度课题组研究成果总结如下。
⼀、病原测序平台
课题组开展了⼆代宏基因组学( mNGS)和三代纳⽶孔测序平台的转化应⽤研究。该⽅向获得⼴州市科技
局(市校联合项⽬),呼研院—哈佛项⽬各 1项及横向课题的资助, 2021年共发表⾼⽔平的 SCI⽂章 4篇,获得授权发明专利 1项。(发明专利:马尔尼菲篮菌诊断的特征物及其筛选⽅法和应⽤。 Sci China Life Sci. Ann Transl Med.Front Microbiol.J Genet Genomics. )
借助于三代测序技术—纳⽶孔测序,证实 COVID-19患者长排毒和复阳不但可能与病毒的A1,430G ,C12,473T 和
G227A 等基因突变有关;⽽且与某些免疫相关基因,如IL1R1 ,IL1R2 和TNFRSF21 在宿主中的过度表达有关(Sci China Life Sci. 2021 ,64(12):2129-2143)。
⼆、肺部真菌病⼤数据平台
在国家呼吸系统疾病临床医学研究中⼼的协调,及⼴州天鹏计算机科技有限公司的协助下,建⽴了肺部真菌病的⼤数据库和平台,实现了平台的转化应⽤。该⽅向获得多项横向课题的资助, 2021年共发表⾼⽔平的 SCI⽂章2篇,其中 1篇已被接收发表。( Emerg Microbes Infect.)
通过⼈⼯智能和⼤数据分析(本院单中⼼数据),发现2013 年-2019 年之间,肺真菌病患者的数量逐年增多;住院患者中,14-30 年龄组患者数量增长趋势最快;肺曲霉病,马尔尼菲篮状菌病,肺孢⼦菌肺炎有上升趋势,且马尔尼菲蓝状菌病等既往认为少见疾病占⽐逐年增加(Emerg Microbes Infect. 2021 Dec;10(1):450-460)。
三、肺部真菌感染与免疫研究平台
作为本课题组的重点研究⽅向,经过多年的努⼒和发展,已经形成稳定的研究⽅向—肺部真菌病临床诊治和发病机制研究。通过特⾊在于肺部真菌病新的诊断⽅法学和挖掘新的⽣物标志物,组学技术探索疾病的发病机制,以及从真菌感染与宿主免疫反应的⾓度阐述新的发病机制等。在该⽅向,获得省⾃然课
题(⾯上项⽬) 1项,⼴州市科技局(市校联合项⽬) 1项,呼吸疾国家重点实验室⾃主课题和开放课题 3项,和横向课题的资助, 2021年共发表⾼⽔平的 SCI⽂章6篇,获得授权的发明专利 1项。( Front Med (Lausanne). Ann Clin Lab Sci.Front Cell Infect Microbiol. BMC Infect Dis. J Microbiol Immunol Infect. J Microbiol Immunol Infect.)
前期建⽴了马尔尼菲篮状菌病全国多中⼼临床研究队列,基于鞘脂代谢组学,发现3个标志物的ROC曲线下⾯积(AUC)>0.90,Sa (d16:0)(AUC: 0.928, 95% CI: 0.856-0.988);SM (d34:0(OH)) (AUC: 0.922, 95% CI: 0.856-0.988);SM (d18:2/24:0)(AUC: 0.905, 95% CI: 0.833-0.977)。其中Sa (d16:0)于微⽣物感染后总体呈明显的下调现象,⽽于马尔尼菲篮状菌病组的⽔平更明显低于其他感染组,
因此Sa (d16:0)被视为马尔尼菲篮状菌病患者的特异性诊断标志物(J Microbiol Immunol Infect. 202115;S1684-1182(21)00098-0)。
前期建⽴了马尔尼菲篮状菌病全国多中⼼临床研究队列,基于免疫学研究技术,发现抗γ⾃⾝抗体阳性患者⾎清与正常⼈⾎清培养 10 天后,通过马尔尼菲篮状菌裂解物进⾏重刺激,结果表明抗γ⼲扰素⾃⾝抗体阳性组分泌 IFN-γ + 的
⼈⾎清培养 10 天后,通过马尔尼菲篮状菌裂解物进⾏重刺激,结果表明抗γ⼲扰素⾃⾝抗体阳性组分泌 IFN-γ + 的CD4+ T 细胞百分⽐明显低于正常⾎清组,具有统计学意义(P<0.05 )(BMC Infect Dis. 2021 Jun 19;21(1):587)。
四、抗肺部真菌药物药效与机制研究平台
抗真菌是肺部真菌病临床诊治的重要组成部分,但现在的抗真菌药具有它的局限性:耐药、昂贵、副作⽤等。因此,本课题组聚焦于从传统中草药中挖掘和研究新型抗真菌药物,希望能研究出⾼效低毒、价廉的新型抗真菌药物弥补临床的缺陷。前期获得了 2项横向课题的资助,聚⼤蒜辣素、⽇达仙等抗真菌的药效和机制研究⽅向,虽未出⽂章,但1项发明专利已经⼊实质审查阶段。
及时抗真菌对于肺部真菌的转归⾄关重要,⽽现有的的抗真菌药物价格昂贵,
回望过去,总结 2021年的研究成果是希望能以此为⽬标,不断的突破⾃我。期待在 2022年⾥,课题组能有更好、更⾼的发展;同时,也期盼志同道合的同⾏、同学加盟,⼀起打造中国肺部真菌病研究的⾼地。
课题组 PI
叶枫主任医师 / 副教授
主任医师,博⼠⽣导师 /博⼠后合作导师
⼴州医科⼤学附属第⼀医院 /⼴州呼吸健康研究院(呼吸与危重症医学科),呼吸内科副主任
呼吸疾病国家重点实验室 PI
学术任职:
中华医学会呼吸分会感染学组委员 (第七 ~⼗届 )
中国医师协会呼吸医师分会呼吸系感染⼯作委员会委员
中国⽼年医学会呼吸病学分会呼吸系统感染学术委员
中国结核病防治综合质量控制专家委员会委员
中国医院协会抗菌药物合理应⽤⼯作委员会委员
⼴东省医学会呼吸病学分会委员会常委、感染学组组长
⼴东省医学会医院感染预防与控制学分会常务委员、抗感染组组长⼴东省药学会呼吸⽤药专家委员会副主任委员
⼴东省⼥医师协会呼吸与危重症专业委员会副主任委员
⼴东省精准医学应⽤学会抗感染分会副主任委员
⼴东省医学会结核病学分会常务委员
⼴东省药事管理与药物学委员会委员
⼴东省卫⽣健康委员会免疫规划专家咨询委员会委员
课题组核⼼⾻⼲
李征途博⼠
主治医师 /讲师,硕⼠研究⽣导师
⼴州医科⼤学附属第⼀医院⼴州呼吸健康研究院(呼吸与危重症医学科)
⼴州市青年后备⼈才;⼴州医科⼤学“南⼭学者”后备⼈才;⼴州医科⼤学附属第⼀医院青年优秀⼈才
⼴东省医学会医院感染预防与控制学会第⼀届青年委员会副主任委员
⼴州市医学会呼吸病学分会委员兼秘书
以第⼀作者⾝份在Clinical infectious diseases,Emerging microbes & infections, Science China-Life sciences,European Journal of immunology,Respirology, BMC Infectious Diseases,Life Sciences,Molecules,Journal of Thoracic Disease,Trials, BMJ Open,和中华结核与呼吸杂志等国内、外著名杂志中发表30余篇⾼⽔平的学术论⽂。申请国家级发明专利8项,已授权6项,其中 1项实现了转化应⽤;主持国⾃然青年基⾦ 1项;呼吸疾病国家重点实验室⾃主课题2项;参与多项国家⼗三五,重⼤专项,国⾃然⾯上,国际合作项⽬等的研究⼯作。
占扬清博⼠
⼴州医科⼤学附属第⼀医院,⼴州呼吸健康研究院
主治医师,硕⼠⽣导师

本文发布于:2024-09-21 18:57:41,感谢您对本站的认可!

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