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来源：《科学中国人·下旬刊》2020年第08期
最新统计数据显示，中国口腔癌发病率为3.35/10万，死亡率为1.56/10万。由于我国人口基数庞大，并且肿瘤所在部位特殊，使得口腔癌成为严重影响我国大众健康的恶性肿瘤之一。口腔癌的发病机制复杂，既包括烟酒各种理化刺激和炎症、免疫、病毒等外在因素，更包括机体遗传易感性导致的DNA损伤等内在因素。由于口腔癌是一类因基因异常产生的疾病，因此进行口腔癌发生发展相关功能基因的阐明，筛选和确定诊断和的相关分子靶标，进而开展分子分类指导的个体化新技术和靶向药物的研发，已成为国内外研究的重点和前沿。 紧抓口腔癌研究的重点和瓶颈，上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔颌面-头颈肿瘤科学科带头人张陈平主任领导的口腔癌诊治团队已达到国际前沿水平。虽如此，陈万涛心中始终有这样的信念，作为救死扶伤的医生，更是代表国内外口腔癌诊疗水平的团队，是否还可以做得更好？是否可以把生存率和生存质量提高、再提高？他所在的团队都希望，通过不断摸索能到更好的诊断和口腔癌的新方法和新技术。
口腔癌分子分类有了中国数据
2020年5月19日，上海市科学技术奖励大会传来喜讯，陈万涛领衔的项目“口腔颌面部
肿瘤组织样本和生物信息库的建立和应用”喜获2019年度上海市科技进步奖一等奖。这是在大力推进我国精准医疗进程中，上海市政府对陈万涛团队为推动口腔癌诊治新技术发展所做工作的充分肯定和认可。 口腔癌发病机制的阐明和诊治靶点的筛选确定，必须依赖足够多的口腔癌组织样本、临床病理和生物信息数据。因此建立标准化的口腔癌样本和生物信息库，成为推进我国口腔癌精准医疗发展的重要条件。
早在20世纪中期，欧美等发达国家已建立包括口腔癌在内的各种规模的肿瘤组织样本库，并分别对肿瘤的遗传学数据进行了获取、分析和应用。但由于种族和致病因素的差异，欧美人口腔癌基因表达谱型和致病基因与中国人存在很大差异。因此，建立中国人为主的口腔癌组织样本库，并解析中国人特有的基因表达谱和致病基因，进而筛选、验证口腔癌发生、发展的关键基因和诊治分子靶标等转化研究滞后，已成为限制我国口腔癌分子分类指导的个体化最主要的瓶颈问题。
“这一问题的解决无疑具有重要的科学意义和社会价值。人类组织样本和遗传信息资源驱动的生物医药产业已经成为各国经济发展的引擎，在当前复杂国际局势和背景下，遗传资
源已成为国家的战略资源，对于遗传资源的保藏、管理和合理利用，已是事关国家安全、发展全局和人民健康的重大战略问题。”陈万涛说。
为了从根本上解决上述关键问题，陈万涛作为上海市（第三期）重点学科（口腔基础医学）的学科带头人和第5任上海市口腔医学研究所所长，在上海交通大学（原上海第二医科大学）口腔医学前任学科带头人邱蔚六院士和现任学科带头人张志愿院士的引领和直接指导下，在口腔颌面-头颈肿瘤科学科带头人张陈平主任及科室全体同仁的全力支持和努力下，依托国家“双一流”学科、国家口腔疾病临床医学研究中心、上海第九人民医院口腔颌面-头颈肿瘤科和口腔病理科等学科，成功建立了以口腔癌为主要病种的口腔颌面部肿瘤组织样本库，以及多组学数据为主体的新型生物样本和生物信息学数据平台；并率先针对中国人构建了涵盖肿瘤组织样本完整遗传学和表观遗传学多组学数据的、高内涵新型口腔癌生物信息数据库；提供了中国人特有的口腔癌功能基因、特异谱型及候选诊治分子靶标；初步建成了有自主知识产权的口腔癌临床和分子分类智能数据库。
目前肿瘤组织样本库已保藏1.3万多例口腔肿瘤患者的组织样本，样本数达到10万多份，实现了对中国人口腔肿瘤特病种样本资源的有效保护和管理；生物信息数据库实现了
基于数字化技术对包括基因表达谱、基因突变谱等8类口腔癌相关遗传和表观遗传学数据资源的有效管理和共享，有效对接了口腔癌分子分类、药物研发和临床新产品开发等领域对组织样本的多元化需求；口腔癌临床和分子分类智能数据库则为基于分子分类指导口腔癌个体化临床应用提供了技术和条件。
因创新性地改变了生物样本库单纯提供实体型组织标本的传统共享模式，并从根本上解决了不可复制的组织样本资源稀缺、共享困难和低效利用等专业内难题，肿瘤组织样本库被国内外专家誉为肿瘤专科组织样本库建设的典范。通过严格的专家评审和现场检查等程序，组织样本和生物信息学数据平台“上海市口腔颌面部肿瘤组织样本及生物信息库”于2014年进入上海市专业技术服务平台建设行列，陈万涛担任主任，平台曾先后两期被上海市科委评估为优秀。
世界卫生组织国际癌症研究所实验室服务与生物样本库中心主任、国际生物及环境样本库协会（ISBER）前任主席Zisis Kozlakidis等多位国际机构权威专家，对专业技术平台和基于平台产出成果的先进性和重要性也给予了高度评价，认为平台对有效推动全球精准医疗发展具有积极作用，平台在标准化口腔颌面部肿瘤专科组织样本和生物信息库的规模等指标上达到同领域的国际领先水平。
近年来，基于组织样本和生物信息库平台开展的研究，陈万涛团队仅在国际专业领域的知名SCI杂志就发表論文50多篇，被SCI论文引用1300多次；成果获得4个国家的国际专利、3项中国专利和1项软件著作权。凭借创新性、重要性和实用易推广性，依托陈万涛牵头成立的全国卫生产业企业管理协会精准医疗分会国内平台，这些成果已得到了广泛的推广和应用，为120多家单位提供组织样本和遗传信息数据。更有价值的是，依赖样本和生物信息库的建设，在国家重点研发计划项目资助下，基于多组学数据获取和分析，他带领该领域全国顶尖团队进一步对口腔癌发生过程中多组学数据进行深度挖掘和整合分析，完成了口腔癌突变类型和分型、主要功能分类、差异表达基因参与的关键信号通路和调控节点等深度分析。为多层面、多维度解析口腔癌分子发病机制和确定诊治分子靶标提供了全球独一无二的数据资源。
寻口腔癌发病基因“密码”
陈万涛带领团队，不仅建立了以中国人为主的口腔癌组织和生物信息学样本库，为精准医疗诊治新技术发展奠定了坚实基础，聚焦口腔癌分子分类技术研发，团队更为寻口腔癌发病的基因“密码”做出了重要贡献。
精准医学是目前临床诊疗新技术发展的突破口和着眼点，肿瘤精准医学的开展，必须到相关分子标志物，用于分子分类、分子预测等，根据生物标志物的检测结果来对病人施行个体化，这样不仅疗效更好，还能降低不良反应。
19世纪60年代，美国的研究人员发现慢性骨髓性白血病患者的细胞中第22号染体明显短一些，因此认为癌症的发生可能与染体的突变有关。之后，又经过20多年的研究发现，慢性骨髓性白血病患者的两条染体之间的交叉错位形成了一种融合基因，导致细胞恶性增生，最终形成了恶性肿瘤。
这一發病机制的研究，是人类首次从分子水平上认识到恶性肿瘤与基因的关系，是人类医学史上具有里程碑意义的一大发现。从此以后，更多的科学家投入到恶性肿瘤发病基因的研究中，寻各种恶性肿瘤的基因“密码”。
2004年，陈万涛负责一项国家自然科学基金重点项目，在这个项目中他对口腔鳞癌的
发病、诊断和相关基因展开了深入、系统的研究。肿瘤的发病原因主要与遗传和环境两大因素相关，于是陈万涛带领团队通过改变动物基因，再加以化学致癌药物的诱导，成功建立了遗传和环境互作的肿瘤动物模型，以此来研究口腔癌的发病原因，寻和验证口腔癌诊断、的候选分子靶点。所做工作为后期进行临床转化和标志物研究提供了基础并积累了丰富的经验。
2016年，作为首席科学家，陈万涛又获得一项国家重大科研项目改革后的“十三五”第一批国家重点研发计划“口腔癌分子分型和精准预防诊治标志物的研究”。这是目前国内精准医学领域恶性肿瘤分子分型方向设立的10个研究项目之一，该项目是一个全国范围的协作项目，分为3个课题，由6所大学、18家医疗单位和34位课题骨干共同承担。
“大型的科研项目，下面分设多个课题和子课题，我们会定期召开项目研究进展汇报会议，对项目、课题的研究进展以及遇到的问题进行讨论，并邀请相关的专家进行全程指导和实施过程把关。”陈万涛介绍。
在18家医院和科研院校组成的国内口腔癌精准医疗团队的通力合作下，陈万涛带领大家完成了对口腔鳞癌发生过程中多组学数据的获得和组学基本谱型的分析，并在此基础上建立
起了多个通用的生物信息学分析软件和模型，对口腔鳞癌演变过程中的分子谱型、基因突变类型、主要调控网络和关键信号通路进行了深度挖掘和分析，在口腔癌基因突变和表达谱型、口腔鳞癌血清miRNA谱型、唾液miRNA诊断和预后标志物、长链非编码RNA预后预测分子谱型等方面取得了系列原创性的研究成果。
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