制药产业是保障民生健康的基础产业之一，但在保障百姓健康的同时，制药过程中产生的大量有毒有害废弃物也严重危害着人们的健康。制药工业生产工序繁多，使用原料种类多、数量大，原材料利用率低，产生的“三废”量且成分复杂。制药工业的“三废”包括了制药工业生产中产生的废液、废气、废渣，它们都属于环境科学中定义的污水、大气污染物、固体废物的范畴，对环境和人体都有着严重的危害。 制药废水的产生主要包括：工艺，如各种结晶母液、转相母液、吸附残液等；冲洗废水，包括反应器、过滤机、催化剂载体、树脂等设备和材料的洗涤水，以及地面、用具等地洗刷废水等；回收残液，包括溶剂回收残液、副产品回收残液等；辅助过程废水，如密封水、溢出水等；厂区生活废水。其特点包括：废水的水质、水量变化大；多含生物难以降解的物质和微生物生长抑制剂；化学合成制药废水COD和SS高，含盐量大，主要污染物质为有机物，如脂肪、苯类有机物、醇、酯、石油类、氨氮、硫化物及各种金属离子等。 制药工业废水常用的处理方法大多为：物化法、化学法、生化法、其他组合工艺等。
物化法 是根据制药废水的水质特点，在其处理过程中需要采用物化处理作为生化处理的预处理或后处理工序。目前应用的物化处理方法主要包括混凝、气浮、吸附、氨吹脱、电解、离子交换和膜分离法等。
化学法包括铁炭法、化学氧化还原法、深度氧化技术等。应用化学方法时，某些试剂的过量使用容易导致水体的二次污染，因此在设计前应做好相关的实验研究工作。
含盐废水处理
生化处理技术是目前制药废水广泛采用的处理技术。由于制药废水中有机物浓度很高，所以一般需要用厌氧和好氧相结合的方法才能取得好的处理效果。好氧生物处理有普通活性污泥法、序列间歇式活性污泥法、生物接触氧化法等。厌氧处理中常用工艺有升流式厌氧污泥床、厌氧流化床、厌氧折流板反应器等。
其它组合工艺 ，制药废水仅靠单一的处理工艺很难使出水达标排放，必须采用多种工艺联合处理的方法，才能稳定达标排放。
药厂排出废气种类包括:含悬浮物废气，来源于原材料的粉碎，粉状药品，中间体及锅炉燃烧等；含无机物废气，包括HCl、NO等；含有机物的废气。
制药工业废气处理工艺 , 从处理的机理考虑, 主要分为四类 。
(1)物理法 物理法治理废气时,不改变废气物质的化学性质,只是用一种物质将它的臭味掩廠和稀释, 或者将废气物成由气相转移至液相或固相。 常见方法有掩蔽法、稀释法、冷凝法和吸附法等。
(2)化学法 化学法是使用男外一种物成与废气物质进行化学反应,改变废气物质的化学结构,使之转变为无毒害的物质、无臭物质或臭味较低的物质。常见方法有燃烧法、氧化法和化学吸收法(酸械中和法)等。
(3)生物法 生物法净化无机或有机废气是在已成熱的采用微生物处理废水的基础上发展起来的。生物净化实质上是一种氧化分解过程:附着在多孔、潮湿介质上的活性徽生物以废气中无机或有机组分作为其生命活动的能源或养分, 转化为简单的无机物(C02、 H20)或细胞组成物质。
(4)物理化学法 物理化学法主要是针対目标废气的特性,采用一系列物理和化学处理相结合的方法,运用一些特殊处理手段和非常规处理方法,对其进行深度处理, 以达到高去除率和无
害化的目的 。 目前应用的简单物理化学方法主要有酸喊吸收、化学吸附、氧化法和催化燃烧等几种方法有机结合的处理方法。
药厂常见废渣包括：蒸馏残渣，失活的催化剂，废活性炭，胶体残渣，反应残渣;不合格的中间体和产品，以及沉淀、生物处理等污泥残渣等。
废渣的处理方法有综合利用法、焚烧法和填土法。
综合利用法实质上是资源再利用，这样不仅解决了废渣的污染问题，而且实现了资源的充分利用节约了生产成本。
焚烧法是使被处理的废渣与过量的空气在焚烧炉内进行氧化燃烧反应, 从而使度渣中所含的汚染物在高温下氧化分解而被破坏, 是一种高温处理和深度氧化的综合工艺,焚烧能大大减少废渣的体积,消除其中的许多有害物质,同时又能回收热量,因此,对于一些暂时无回收价值的可燃性废渣,特别是当用其他方法不能解決或处理不彻底时, 焚烧则是一个有效的方法。该法可使废渣完全氧化成无害物质, COD的去除率可达99.5%以上。因此,适宜处理有机物含量较高或热值较高的废渣。
填土法即土地填埋废渣。
在制药三废处理这一领域里，虽然经过一百多年的发展，至今已经比较成熟，但是仍然存在着诸多问题，只有采用多种工艺联合处理的方法，才能做到稳定达标排放，甚至是变废为宝，实现资源综合利用的目的。
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