论著·论述生物信息学分析和预测Snai1的靶向作用miRNA分子
刘汉雄1 曹媛媛2 刘子声1 欧文胜1
1南华大学附属郴州市第一人民医院消化内科 湖南省郴州市 423000
2南华大学附属郴州市第一人民医院ICU 湖南省郴州市 423000
【摘 要】目的：通过生物信息学方法预测和寻Snai1的靶向作用miRNA分子。方法：通过生物信息学软件分析Snai1的靶向作用miRNA分子，再通过热力学稳定性评分和序列保守性评分，对所获得miRNAs分子进行分析，获得与Snai1结合特异性最好，稳定性最高的靶miRNA。结果：预测到有12个miRNAs可与Snai1结合；其中，miR-199a-5p、miR-410与Snai1结合的稳定性和特异性较好。结论：miR-199a-5p、miR-410可能是Snai1的靶miRNA。 【关键词】生物信息学；Snai1；miRNA；靶基因
Snai1基因超家族是一类具有锌指结构
的转录抑制因子家族，Snai1家族基因对脊
椎动物神经脊和中胚叶组织的形成具有重
要作用，往往在间叶组织中表达，因而被
认为是一种间叶源性标志物[1]。
miRNA-靶基因之间的调控具有一定
的特异性和互补性[2]。通过相关软件预测
miRNA-靶基因之间的结合，可以为下一
步实验提供理论基础。本研究通过通过生
物信息学软件预测与Snai1结合的miRNA
分子，以确定miRNA-Snai1之间的相互作
用。
1 方法
1.1 miRWalk预测与Snai1结合的miRNA
分子
miRwalk在线程序可通过10个生物信息学软件进行“交集”分析与Snai1结合的miRNA分子。
1.2 miRanda软件对与Snai1结合miRNA 分子进行评分
将Snai1基因输入miRanda在线程序，进行热力学稳定性评分和序列保守性评分，以预测与Snai1结合特异性和稳定性较好的miRNA分子。
2 结果
2.1 获得12个与Snai1结合的miRNA分子
10个软件当中有6个软件预测到有12个miRNAs可与Snai1结合：miR-30d，miR-30b，miR-30c，miR-410，miR-153，miR-125a-5p，miR-522，miR-615-5p，miR-199a-5p，miR-125b，miR-30e，miR-3a。
2.2 与Snai1结合miRNA分子评分结果
miRanda软件进行热力学稳定性评分
和序列保守性评分，结果发现：miR-199a-
5p、miR-410与Snai1结合的热动力学得分
分别排第1、第2，说明结合稳定性和特异
性较好，同时，序列保守性得分也高。因此，
miR-199a-5p、miR-410可能是Snai1的靶
miRNA。如表1所示。
3 讨论
研究发现，Snai1基因与细胞增殖、细
胞动力学、细胞周期调节及细胞凋亡等有
密切关系[3]，其异常表达可导致细胞形态
发生改变，细胞间连接缺失，细胞获得侵
袭潜能，促进肿瘤发生[4]。Snai1表达下调
可能与miRNA调控有关。
miRwalk通过多个生物信息学软件同
时预测分析miRNA-靶基因之间的结合，
不同的软件采用的算法不同，预测的结果
可能会有一些差异。结合多个软件的结果
进行预测，则可信度较好[5]。miRwalk预
测到了有12个miRNAs可与Snai1结合，
说明这些miRNAs与Snai1结合的可能性
较大，但结合特异性尚不明了，必须对这
些miRNAs进一步分析。
分析miRNA-靶基因之间的结合的特
异性和稳定性的生物信息学软件miRanda
主要通过计算miRNA-靶基因之间的结合
的热动力学、序列保守性来计算他们之间
结合的特异性和稳定性[6]。本研究结果发
现：miR-199a-5p、miR-410与Snai1结合
的热动力学得分比较低，说明结合稳定性
和特异性较好，同时，序列保守性得分也
高。因此， miR-199a-5p、miR-410可能是
mirna靶基因分析Snai1的靶miRNA。
miR-199a-5p在胃癌中是一个候选癌基
因，其在胃癌中表达增高，促进胃癌的侵
袭和转移[7]。而miR-410作为抑癌因子可
通过靶向MDM2，抑制胃癌细胞的侵袭转
移[8]。由于Snai1是一个已知的癌基因，
因此，miR-410靶向结合Snai1的可能性更表1：预测的12个miRNAs的mirSVR得分和PhastCons得分
热动力学得分热动力学排名序列保守性得分序列保守性排名hsa-miR-199a-5p-1.239710.71821
hsa-miR-410-1.231520.70782
hsa-miR-30a-1.125830.67193
hsa-miR-30b-1.125830.67193
hsa-miR-30c-1.125830.67193
hsa-miR-30d-1.125830.67193
hsa-miR-30e-1.125830.67193
hsa-miR-153-0.894180.53898
hsa-miR-615-5p-0.342490.427011
hsa-miR-522-0.1293100.388212
hsa-miR-125b-0.0265110.51239
hsa-miR-125a-5p-0.0263120.51239
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2017.02
论著·论述
吕治平
宁夏医科大学总医院普胸外科 宁夏回族自治区银川市 750001
【摘 要】目的：探讨胸腔积液采用中心静脉导管置管引流术的效果。方法：研究对象来自我院2015年5月至2016年12月期间收治的80例胸腔积液患者，随机划分为对照组与观察组各40例，对照组采用常规胸腔穿刺，观察组采用中心静脉导管置管引流术，分析不同方法后的患者疗效与后并发症情况。结果：在成功率上，观察组为97.5%，对照组为85%，两组差异具有统计学意义，p<0.05；在并发症率上，观察组为0%，对照组为12.5%，两组差异具有统计学意义，p<0.05。结论：胸腔积液采用中心静脉导管置管引流术适用性较广，成功率高，同时并发症少，效果与安全均有保证。
【关键词】胸腔积液；中心静脉导管置管引流术；效果
胸腔积液可以广泛的发生在胸膜与肺部疾病中，一般可以通过胸水来对积液情况做判定。穿刺引流属于临床常见诊治疾病，但是进行反复性穿刺会提升患者痛苦，同时感染、出血与气胸等并发症发生率更高，同时也会受到抽液量的局限性[1]。而中心静脉导管可以有较好的弹性，组织相容性也相对更好，通过长时间置入使用可以有效的避免反复性穿刺等操作，舒适度更强。本文通过研究我院2015年5月至2016年12月期间收治的80例胸腔积液患者，分析运用中心静脉导管置管引流术治
疗的效果，现报告如下：
1 资料与方法
1.1 一般资料
研究对象来自我院2015年5月至
2016年12月期间收治的80例胸腔积液患
者，随机划分为对照组与观察组各40例，
对照组男性26例，女性14例；年龄范围
为22岁至85岁，平均年龄为（54.2±4.1）
岁；脓胸为1例，结核性胸腔积液为21例，
恶性胸腔积液为18例；观察组男性25例，
女性15例；年龄范围为21岁至87岁，平
均年龄为（56.7±3.4）岁；脓胸为2例，
结核性胸腔积液为24例，恶性胸腔积液为
14例；所有患者均通过胸片与B超做有效
确诊，同意与研究工作的进行，签署
同意书。两组患者在基本的年龄、性别、
病情上没有显著性差异，具有可比性。
1.2 方法
对照组采用常规胸腔穿刺，观察
组采用中心静脉导管置管引流术，病情通
高。由于miRNA-靶基因与靶基因之间的结合调控具有很大的不确定性，为了进一步证实miRNA-靶基因之间的结合，需通过后续实验选取miR-199a-5p、miR-410做实验验证以及功能研究。
（通讯作者：欧文胜）
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作者简介
刘汉雄，男。大学本科学历。主治医师。
在读研究生。南华大学附属郴州市第一人
民医院消化内科。
欧文胜，副主任医师。南华大学附属郴州
市第一人民医院消化内科。
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