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1 古菌域(Archaea)
2 细菌域(Bacteria)
3 真核生物域(Eukarya)
3.1 植物界(Plantae)
3.2.1 动物界(Metazoa)
3.2.2 真菌界(Fungi)
3.3 其余真核生物（原生生物和真核藻类）
4 病毒和类病毒
古菌域(Archaea)
包含嗜盐菌、一些超嗜热菌、嗜酸菌等。
参见古菌分类表。
细菌域(Bacteria)
包含蓝藻、放线菌、衣原体、支原体、立克次体等。
参见细菌分类表。
真核生物域(Eukarya)
植物界(Plantae)
包含绿藻、轮藻、苔藓植物、蕨类植物、种子植物等。
参见植物分类表。
真菌/后生动物组
真菌/后生动物组除动物界和真菌外，还包含领鞭毛虫、鱼醉菌等。
动物界(Metazoa)
即“后生动物”。
参见动物分类表。
真菌界(Fungi)
参见真菌分类表，包括子囊菌、担子菌、接合菌、壶菌、Glomeromycota和微孢子虫。
金藻纲(Chrysophyceae)
硅鞭藻纲(Dictyochophyceae)
针胞藻纲(Raphidophyceae)
前毛壶菌纲(Hyphochytriomycetes)
卵菌纲(Oomycetes)
褐藻门(Phaeophyceae)，如海带、巨藻、马尾藻、墨角藻。
硅藻门(Bacillariophyta)
黄藻门(Xanthophyceae)
囊泡虫类(Alveolata)
顶复门(Apicomplexa)，如疟原虫。
纤毛虫类(Ciliophora)，如喇叭虫、中缢虫、榴弹虫、草履虫、四膜虫。
甲藻门(Dinophyceae)
单孢子虫门(Haplosporidia)
丝足虫类(Cercozoa)
根肿菌类(Plasmodiophorida)
粒网足虫类(Granuloreticulosea)，如有孔虫。
叶足纲(Lobosea)，如变形虫（阿米巴）。
黏菌门(Mycetozoa)
灰胞藻纲(Glaucocystophyceae)
红藻门(Rhodophyta)，如石花菜、紫菜。
注：以上真核生物列表不完全，尚包括有其它一些未归类原生生物。
古菌分类表
目錄
1 初古菌門(Korarchaeota)*
2 納古菌門(Nanoarchaeota)*
3 泉古菌門(Crenarchaeota)
3.1 熱變形菌綱(Thermoprotei)
4 廣古菌門(Euryarchaeota)
4.1 甲烷桿菌綱(Methanobacteria)
4.2 甲烷球菌綱(Methanococci)
4.3 甲烷微菌綱(Methanomicrobia)
4.4 鹽桿菌綱(Halobacteria)
4.5 熱原體綱(Thermoplasmata)
4.6 熱球菌綱(Thermococci)
4.7 古球狀菌綱(Archaeoglobi)
4.8 甲烷火菌綱(Methanopyri)
初古菌門(Korarchaeota)*
納古菌門(Nanoarchaeota)*
納古菌屬(Nanoarchaeum)*
泉古菌門(Crenarchaeota)
熱變形菌綱(Thermoprotei)
熱變形菌目(Thermoproteales)
熱變形菌科(Thermoproteaceae)
熱變形菌屬(Thermoproteus)
暖枝菌屬(Caldivirga)
火棒菌屬(Pyrobaculum)
熱分支菌屬(Thermocladium)
火山鬃菌屬(Vulcanisaeta)
熱絲菌科(Thermofilaceae)
熱絲菌屬(Thermofilium)
暖球形菌科(Caldisphaeraceae)
暖球形菌屬(Caldisphaera)
除硫球菌目(Desulfurococcales)
除硫球菌科(Desulfurococcaceae)
除硫球菌屬(Desulfurococcus)
酸葉菌屬(Acidilobus)
氣火菌屬(Aeropyrum)
燃球菌屬(Ignicoccus)
葡萄熱菌屬(Staphylothermus)
(Stetteria)
厭硫球菌屬(Sulfophobococcus)
熱盤菌屬(Thermodiscus)
熱球形菌屬(Thermosphaera)
熱網菌科(Pyrodictiaceae)
熱網菌屬(Pyrodictium)
超熱菌屬(Hyperthermus)
火葉菌屬(Pyrolobus)
硫化葉菌目(Sulfolobales)
硫化葉菌科(Sulfolobaceae)
硫化葉菌屬(Sulfolobus)
喜酸菌屬(Acidiamus)
生金球形菌屬(Metallosphaera)
憎葉菌屬(Stygiolobus)
硫磺球形菌屬(Sulfurisphaera)
硫磺球菌屬(Sulfurococcus)
餐古菌目(Cenarchaeales)*
餐古菌科(Cenarchaeaceae)*
餐古菌屬(Cenarchaeum)*
廣古菌門(Euryarchaeota)
甲烷桿菌綱(Methanobacteria)
甲烷桿菌目(Methanobacteriales)
甲烷桿菌科(Methanobacteriaceae)
甲烷桿菌屬(Methanobacterium)
甲烷短桿菌屬(Methanobrevibacter)
甲烷球形菌屬(Methanosphaera)
甲烷熱菌科(Methanothermaceae)
甲烷熱菌屬(Methanothermus)
甲烷球菌綱(Methanococci)
甲烷球菌目(Methanococcales)
甲烷球菌科(Methanococcaceae)
甲烷球菌屬(Methanococcus)
甲烷熱球菌屬(Methanothermococcus)
firmicutes
甲烷暖球菌科(Methanocaldococcaceae)
甲烷暖球菌屬(Methanocaldococcus)
甲烷炎菌屬(Methanotorris)
甲烷微菌綱(Methanomicrobia)
甲烷微菌目(Methanomirobiales)
甲烷微菌科(Methanomicrobiaceae)
甲烷微菌屬(Methanomicrobium)
甲烷囊菌屬(Methanoculleus)
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