姓名:mangogola
SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳测定蛋白质分子量的原理是:蛋白质在电泳中的迁移速率取决于其所带电荷、分子大小以及形状等因素,而大多数蛋白质与SDS按一定比例结合(1:1.4/g:g),这样使各种蛋白质的SDS-复合物都带上相同密度的负电荷,而且形状为短轴相同的雪茄烟形。由此蛋白质分子的电泳迁移率仅取决于其分子量,在特定凝胶浓度下,一定范围内的蛋白质分子量对数与迁移率呈直线关系,选择分子量范围和性质与待测样品相近的蛋白质作标准蛋白,与样品同时电泳计算得到标准曲线,并根据待测样品的相对迁移率在标准曲线上查出其分子量。 一.实验过程
浓缩胶浓度4%,交联度2.7% |
[Acr(30%):Bis(0.8%)]溶液 | 0.67ml |
dd水 | 3.05ml |
0.5M pH6.8 Tris-Hcl(0.4%SDS)溶液 | 1.25ml |
TEMED(原液) | 6ul |
将以上成分加入小烧杯中轻轻摇匀,加入10%的硫代硫酸铵0.026ml,摇匀后灌胶。 |
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分离胶浓度12%,交联度2.7% |
[Acr(30%):Bis(0.8%)]溶液 | 4ml |
dd水 | 3.44ml |
1.5M pH8.8 Tris-Hcl(0.4%SDS)溶液 | 2.5ml |
TEMED(原液) | 6ul |
将以上成分加入小烧杯中轻轻摇匀,加入10%的硫代硫酸铵0.056ml,摇匀后灌胶。 |
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1.凝胶工作液的配制
2.灌制分离胶
将制胶玻璃板清洗安装紧密后,插入制孔器,在距制孔器下端1cm处做一标记,取下制孔器将分离胶溶液加入两块玻璃板之间至标记处。然后立即用注射器向凝胶液面轻轻铺上一层厚约0.5cm的dd水,目的是使凝胶面平整,放置待其聚合凝固。
3.灌制浓缩胶
将分离胶上的双蒸水用注射器取出并用滤纸吸干,放入制孔器,用滴管灌入浓缩胶至玻璃板顶端待其聚合凝固。
4.待测样品的制备
取0.1ml透析除盐后的样品稀释液(浓度在0.2mg/ml左右),加入0.1ml样品溶解液,混匀后沸水浴5min,冷却。(沸水浴的目的是使蛋白质变性成肽链,便于与SDS结合,甘油可以增加蛋白质的比重,便于沉降到加样孔底部,不易飘散)
5.加样和电泳
将电极缓冲液注入缓冲液槽,然后轻轻拔出制孔器,加样后连接电泳仪,记录每个加样孔的样品类型及上样量。浓缩胶使用50V恒压,分离胶使用100V恒压。
6.染和脱
用取胶片将两张玻璃板撬开,取出凝胶,切去浓缩胶部分及染料前端至分离胶底端部分,并在剩余胶片的右上角切去一块作为标记。而后转入盛有染液的大培养皿中,低速振荡
染1.5h,然后分别用高浓度和低浓度甲醇溶液脱1.5h,最后用低浓度甲醇溶液脱过夜至背景脱。
二.数据记录和处理
1.标准曲线绘制
蛋白质Marker的相对迁移率如下表:
类别 | 分子量M | ㏒M | 样品迁移距离(cm) | 染料迁移距离(cm) | 相对迁移率 |
兔磷酸化酶B sds聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 97400 | 4.988559 | 0.95 | 4.3 | 0.220930 |
牛血清白蛋白 | 66200 | 4.820858 | 1.48 | 0.344186 |
兔肌动蛋白 | 43000 | 4.633469 | 2.2 | 0.511628 |
牛碳酸酐酶 | 31000 | 4.491362 | 2.85 | 0.662791 |
胰蛋白酶抑制剂 | 20100 | 4.303196 | 3.6 | 0.837209 |
鸡卵清溶菌酶 | 14400 | 4.158363 | 4.2 | 0.976744 |
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标准曲线绘制如下:
即标准曲线为:㏒Mr=5.20519-1.07931*m
2.计算样品分子量
样品迁移率记录如下表:
类别 | 样品迁移距离(cm) | 染料迁移距离(cm) | 相对迁移率 | 分子量 |
天花粉蛋白 | 3.05 | 4.3 | 0.7093023 | 27519 |
胰蛋白酶 | 3 | 0.6976744 | 28326 |
人血清白蛋白 | 1.45 | 0.3372093 | 69380 |
牛血清白蛋白 | 1.46 | 0.3395349 | 68981 |
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三.分析与讨论
1.影响蛋白质和SDS结合的因素主要有:①二硫键是否被完全还原,只有在蛋白质分子内二硫键被彻底还原的情况下,SDS才能定量结合到蛋白质分子上,并使之具有相同的构象,
一般以巯基乙醇作还原剂;②溶液中SDS的总量至少比蛋白质高三倍,一般需高达10倍以上;③溶液中的离子强度应较低,最高不超过0.26,所以样品要经透析处理。
2.在凝胶电泳中影响迁移率的因素有很多,而在制胶和电泳过程中,很难每次都将各项条件控制的完全一致。因此,用SDS凝胶电泳测分子量,每次测定样品必须同时做标准曲线,而不得利用另一次电泳的标准曲线。
3.凝胶电泳所用试剂要求严格,需准确配制。
4.胰蛋白酶在pH3.0下稳定,但透析后容易自容,所以上样时应尽量多一些,大约30-40uL。
附:
1. 样品溶解液(2×) 2.脱液
3.电极缓冲液(5×)
Tris 7.57g
Gly 36.03g
10%SDS 25.0mL