一、概述
质粒是一种广泛应用于分子生物学研究中的载体,其命名规则对于实验室管理和数据交流具有重要意义。本文将详细介绍质粒命名的规则。
二、基本要素
1. 质粒名称应简洁明了,避免使用过长或过于复杂的名称。 2. 质粒名称应具有唯一性,不同质粒之间不能出现重复。
pgl33. 质粒名称应具有信息量,能够反映出质粒的基本性质和功能特点。
三、命名方式
1. 基于来源
根据质粒来源进行命名,如pUC19(来源于E.coli)。
2. 基于功能
根据质粒的功能进行命名,如pGEX-6P-1(用于表达融合蛋白)。
3. 基于结构
根据质粒结构进行命名,如pBluescript II SK+(含有多个限制酶切位点)。 4. 基于序列
根据质粒序列进行命名,如pET28a(含有T7启动子和His标签)。
四、命名元素
1. 质粒类型
p:常规质粒(plasmid)
v:病毒载体(viral vector)
b:大肠杆菌人工染体(bacterial artificial chromosome)
y:酵母人工染体(yeast artificial chromosome)
2. 来源
使用缩写表示不同来源的质粒:
pUC:来源于E.coli DH5α
pBR:来源于E.coli K12
pRS:来源于酵母菌
3. 功能
使用缩写表示不同功能的质粒:
GEX:用于表达融合蛋白(glutathione S-transferase fusion expression)
GST:含有谷胱甘肽S-转移酶标签(glutathione S-transferase tag)
His:含有组氨酸标签(histidine tag)
4. 结构
使用缩写表示不同结构的质粒:
KS:含有多个限制酶切位点(multiple cloning sites)
SK+:含有T3、T7和SP6启动子(T3/T7/SP6 promoter)
5. 序列
使用缩写表示不同序列的质粒: