一支红杏出墙来:BCOR基因异常及她的肿瘤君们

一支红杏出墙来:BCOR基因异常及她的肿瘤君们
BCOR基因位于Xp11.4区段,是一种表观遗传调节因子,与特定细胞分化及肢体结构发育相关。近年来发现其基因异常与多种肿瘤的发生相关,主要表现为(1)与CCNB3、ZC3H7B、MAML3、RARA等基因发生融合、(2)外显子15处发生内部重复扩增(Internal tandem duplication)、及(3)多种位置的碱基突变。
涉及的肿瘤主要有:
(1)多种肉瘤如肾脏透明细胞肉瘤、婴儿原始黏液样间叶细胞肿瘤、小蓝圆细胞肉瘤、未分化/未分类肉瘤、子宫内膜间质肉瘤、骨化性纤维黏液样肿瘤;
(2)中枢神经系统肿瘤相关的“CNS-HG-NET-BCOR异常”(伴有BCOR异常的高级别CNS-PNET)、髓母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、胶质瘤;
(3)血液系统相关的肿瘤,如髓系肿瘤中的MDS、MDS伴多系异常、MDS伴原始细胞增多、AML伴11三体、AML伴13三体、黏连蛋白异常相关的髓系肿瘤、成人原发AML、年龄≤65岁的中等细胞遗传学预后患者、AML伴平衡易位患者等;
(4)淋巴瘤如结外NK/T细胞淋巴瘤,鼻型、T细胞幼淋巴细胞白血病、慢淋等;
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(5)癌,如涎腺癌、腺样囊腺癌、子宫内膜癌、胸腺瘤/癌等。
本文主要摘录2019年Astolfi等人发表的综述及部分相关文献,结合我司的相关检测方法及试剂,供大家参考。
如上图:BCOR基因结构示意图。其功能片段包括有BCL6结合位点、MLLT3基因结合位点、ANK重复、PCGF1基因结合位点。
(一)BCOR与肾脏透明细胞肉瘤(Clear cell sarcoma of the kidney)
肾脏透明细胞肉瘤(CCSK)是儿童中第二常见的肾脏恶性肿瘤,约占所有肾脏肿瘤的4%-
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5%。虽然CCSK被认为是不同于肾母细胞瘤的单独一种实体,但是其遗传学研究还相对较少。CCSK遗传学研究取得明显突破的事件是,2015-16年期间,有5个独立的研究都发表数据,显示BCOR基因最后一个外显子(Exon15)内部伴有重现性的内部重复扩增异常(ITD),涉及到PUFD结构域。起码有75%以上的肾脏透明细胞肉瘤样本伴有此种异常,且已鉴定出多种不同的ITD类型。比如,目前一些相关研究的阳性率数据为91%(10/11)、85%(23/27)、83%(132/159)、91%(20/22)、100%(8/8)、75%(3/4)、100%(20/20)。主要涉及到氨基酸1700-1755片段,氨基酸最少的重复数目为22个,最长的为38个,其中最小的重复区域位于氨基酸1725-1737处。ITD大多数异常为重复两次,极少数为重复三次。
如上图:CCSK中的BCOR ITD异常位置举例。
如上图:伴有BCOR ITD异常CCSK的组织学特征,及BCOR蛋白表达(来自Abcam及Santa Cruz公司)。
如上图:伴有BCOR蛋白和CCNB3蛋白都呈表达阳性的CCSK BCOR ITD阳性病例。其具有典型的CCSK组织学特点,卵圆形片状肿瘤细胞、核及胞浆透明样变变化丰富、具有规则的分布均匀的纤细毛细血管。
需要注意:BCOR ITD异常需要提取其DNA,常规PCR+Sanger测序来进行分析。FISH法不能检测。并且,有个用RNA-seq(RNA高通量测序)技术的研究还发现CCSK中有一例(9.1%,1/11)同时伴有BCOR-CCNB3融合异常。
(二)BCOR与婴儿原始黏液样间叶细胞肿瘤(Primitive mesenchymal myxoid tumor of infancy)激光除锈
皂液盒婴儿原始黏液样间叶细胞肿瘤(PMMTI)是一种新命名的儿童肌纤维母细胞肿瘤,中等分级,具有高的局部复发率,但转移潜能低。组织学上具有黏液样基质背景,需要与其他间叶肿瘤相鉴别,如先天性婴儿纤维肉瘤、纤维黏液样肉瘤、肌纤维母细胞肉瘤及隆突性皮肤纤维肉瘤。遗传学上PMMTI伴有BCOR-ITD异常,且几乎所有的病例都伴有BCOR免疫组化高表达,类似于CCSK。两个研究显示,BCOR-ITD的阳性率分别为100%(5/5)及86%(6/7)。还有两篇文献各自报道了一例阳性。最近,Kao等人数据显示这两种肿瘤的
表观遗传学、形态学及基因遗传学多存在重叠,支持PMMTI是等同于原发于软组织的CCSK的另外一种名称。折流板除雾器
(三)BCOR与小蓝圆细胞肉瘤(Small round blue cell sarcomas,SBRCSs)
指纹挂锁典型的尤文肉瘤家族可用过检测EWSR1基因断裂、或与FLI1或FUS融合而得以确诊。尤文肉瘤镜下表现为单一形态的片状圆形细胞形态,伴有规则核仁及散在染质,伴或不伴有菊形团。但是,随着NGS等高通量技术的应用,在未分化肉瘤中已发现一些EWSR1之外的其他融合基因异常。而形态学上未分化肉瘤与尤文肉瘤类似,但是不伴有EWSR1基因易位异常。这类肿瘤被称之为“尤文样小蓝圆细胞肉瘤”(SRBCS)。Kao等人发现,在未分化肉瘤中发现有约一半的病例伴有BCOR ITD异常;而Pierron等人也在其中鉴定出一类伴有BCOR-CCNB3融合的样本出来,且伴有融合蛋白过表达。这些伴有BCOR-CCNB3融合或BCOR ITD异常的样本与尤文肉瘤家族肿瘤不同(常伴有BCOR免疫组化阴性),且具有更宽广的组织学表现。随后,相关研究相继在未分化/未分类肉瘤(尤文样小蓝圆细胞或梭形细胞肉瘤)中发现BCOR-CCNB3融合的样本,其阳性率与检测的样本数量大小而变化较大,数据及采用的方法如下:

本文发布于:2024-09-21 22:14:12,感谢您对本站的认可!

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