消声室制作研究lncRNA的看过来~一起来看看曹雪涛院士的这篇Cell立体绣花
RIG-I 是一种模式识别受体,它能够识别外源性病毒 RNA(dsRNA),之后 RIG-1 的半胱天冬酶募集结构域(CARD)通过 TRIM25 进行 K63 连接的泛素化。 TRIM25 的 RING 和 SPRY 结构域介导其与 RIG-I 的相互作用最后通过 IRF3 的细胞内信号传导途径来产生 IFN。虽然也可以激活 NF-kB 信号通路,但 「VSV infection is a weak NF-kB inducer」(文章中有提到)。 单水合肼Progress in Biochemistry and Biophysics 2013,40(5): 397~405
我们首先来看下这篇文章的模式图,外源性 RNA 病毒入侵后,大量产生的 IFN-I 可以诱导
机体产生 lnc-Lsm3b,而 lnc-Lsm3b 可以与外源性 RNA 病毒竞争性结合 RIG-I 并且使其构象发生改变,最终使 IFN-I 产生减少来维持免疫稳态。
我们再先来看一下这篇文章的 Highlights 与 Figures 之间的联系。
一共 4 点 Highlights,前两点主要说的是 lnc-Lsm3b 与表型之间的关系,而后面两点主要是在概括机制上的内容。拖把挤水器
接下来我们主要来看一下 figures 部分。
Figurees1&S1
作者是怎么到这条 lncRNA 的呢?作者将 RIG-I 拉下来的蛋白去做了 RIP-seq,然后得到了 TOP30 的 lncRNAs。
冰浆机那么这 30 个中哪个是我们想要的呢?接下来对这 30 个 lncRNAs 在小鼠的腹腔巨噬细胞中进行了 knock down,发现只有 lncRNA NONMMUT057981 这条 lncRNA(上图黑箭头所示)在 knock down 之后 VSV-induced IFN-β是上升的。
>光学增强器守卫