新冠病毒数据分析(2):病毒基因组的特点

新冠病毒数据分析(2):病毒基因组的特点
一段只有不到3万个AUGC字母构成的序列,居然能将全世界搞的天翻地覆,数十万人感染,20亿多人居家隔离,全球股市熔断,经济下滑,奥运停办……这恐怕是今年最恐怖的一段语言了,今天我们就来介绍一下病毒基因组。
led驱动电路病毒的基本特点眼部艾灸器
病毒是目前已知地球上最古老的生物,同时也是最简单的物种,因为不具备细胞结构,只能以寄生模式生活。病毒的一生最大的目的就是感染更多宿主,复制更多后代。病毒的感染能力非常强,既可以感染人类,也可以感染其他动物,植物,微生物等,也就是病毒可以感染除了自身以外任何物种。不过一般来说一种病毒只感染一类宿主,比如植物病毒不会感染动物。但是现在越来越多的研究发现人畜共患病的情况,比如禽流感感染人,猪流感感染人等。尤其是哺乳动如之间更容易发生感染,例如21世纪以来的几次病毒大流行包括SARS,MERS,COVID-19等,都是在人与动物之间相互感染的。
病毒完全是寄生生活,因此必须生活在活细胞内,病毒的一生就是与宿主相爱相杀的一生,
病毒离开活体之后只能生存一段时间,不能永久存活,病毒有不同的性格,有的温和,有的烈性,例如埃博拉病毒感染之后会快速杀死宿主;HIV病毒感染之后会整合到人基因组上慢慢的杀死宿主。而新冠病毒则处于中间状态,一直与宿主进行战斗,此消彼长。
逗号刮刀谈“毒”变
其实我们也完全没有必要听到病毒就感到害怕,因为人体内天然就带有很多病毒,尤其是肠道微生物中,不过这些病毒对人没有影响。而且人体基因组的30亿个碱基中就包含很多与病毒相似的序列,也就是我们的人体基因组内已经整合了很多病毒的序列。
病毒基因组的大小
病毒没有细胞结构,并且寄生生活,因此,只需要完成感染和传代两大功能即可,从最有效率的角度来说,基因组必须精简,因此,病毒基因组显著的特点就是非常小。目前已知最小的病毒Circoviridae只有2000多个碱基,编码两个基因。而最大的病毒pandoraviruses大小达到了200万个碱基,不过绝大部分的病毒都只有几十K大小,这次的新冠病毒基因组大小在30K左右 。
病毒基因组分类批量抓鸡
按照构成基因组碱基的不同,病毒分为DNA病毒和RNA病毒,DNA病毒又分为单链DNA病毒和双链DNA病毒,也有双链RNA病毒。单双链的不同也决定了病毒基因组的一些显著特点,单链病毒由于没有互补结构,稳定性更差,因此在复制的过程中更容易出错,也就是更容易发生突变。不过这也不是绝对的,在生物研究领域总是会出现例外。按照病毒遗传物质存在形式有可以分为环形,线形,分段的形态。
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现在测序了多少病毒序列
根据NCBI物种分类数据库现在的统计,截止到目前,一共测序出来了150,000条病毒的序列,这些序列一共来自于4600多个种,1000多个属,因此,我们对病毒的研究还远远不够。

本文发布于:2024-09-22 09:54:55,感谢您对本站的认可!

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