杂合性缺失、纯合性缺失、点突变的原理与检测方法

杂合性缺失、纯合性缺失、点突变的原理与检测方法(总2页)

杂合性缺失、纯合性缺失、点突变的原理与检测方法缺失,就是基因缺失,简单地说是没有了,实际上是不能表达某一蛋白了,或者干脆少了这一个位置。杂合性缺失:实际就是杂合子,一对染体上某一个染体上基因缺失,与之配对的染体上仍然存在。纯合性缺失:实际就是纯合子,一对染体上两个基因都缺失。根据这个基因的特点,表现出来的形状完全不同,比如人类一些疾病就是这样,如果这个缺失基因是隐性基因,杂合子或杂合性缺失会表现出来缺失。实际上这个基因不能继续表达。因为隐性基因只能在纯合子中表现(个别例外,如性染体)。如果这个基因是显性基因,那么这种缺失可能不表现出来。因为显性基因不仅在纯合子中表现,在杂合子也表现。具体应用过程,杂合子可以通过回交等方式,获得纯合子。
    一般来说,对于一个确定的基因要检测在某种病中的突变情况,方法比较成熟,PCR-测序、PCR-SSCP、PCR-RFLP等。如果样本量较少且你所研究的目的基因较小,采用PCR或RT-PCR的方法获得目的片段后直接测序是很可行的方法(目前测序一个反应只有不到6
0元人民币);但如果样本量较大且所研究的目的基因较大的话,直接测序可能费用较高,一般可采用PCR-SSCP、PCR-RFLP。
霓虹灯变压器不管采用哪种方法检测基因的点突变都涉及到PCR扩增目的片段,因而涉及到引物设计,引物设计由你的研究材料、研究方法、目的基因等决定:如果你能得到患者的病灶部位组织材料的话(从这些材料中提取RNA),可根据基因的cDNA序列设计引物(如果目的基因太大,则需要设计多条引物;如果采用PCR-SSCP的方法检测突变,则需要每200bp左右设计一对引物);如果你只能获得患者的血样的话,就从血样中提取基因组DNA,检测基因突变时,必须每个外显子设计一对引物,对于较大的外显子,还需设计多条引物,当然如果采用PCR-SSCP的方法检测突变,同样需要在基因的外显子上每200bp左右设计一对引物。如果你想检测外显子内含子之间的剪接位点突变,可根据目的基因所在的基因组序列设计引物。
    对于缺失(杂合缺失或纯合缺失)的检测方法,一般来说,就是PCR或RT-PCR,然后进行普通的琼脂糖凝胶电泳即可。首先根据缺失部位两侧设计一对引物,然后以基因组DNA或RNA为模板,进行PCR或RT-PCR扩增,普通的琼脂糖凝胶电泳后,可通过扩增产
物及大小直接判断:只得到一条扩增产物且扩增产物与目的片段大小一致的患者,为不存在此部位缺失的患者;只得到一条扩增产物且扩增产物较小的患者,即为纯合缺失;有2条扩增产物,一条与野生型大小相同,另一条与缺失的相同,即为杂合缺失。
 
关于杂合性缺失的检测
vitzj:
检测杂合性缺失通常用定量荧光检测str不同重复次数的峰值.如果两个峰值之前的比例是1:1,说明一对等位基因都存在,未缺失;如果比值不是1:1,且差别比较大,说明可能有杂合性缺失;如果只有一个峰,有两种可能:1.正常基因组是有两个峰的,那么有缺失.2.正常基因组只有一个重合峰,则看标本的峰是不是将近两倍高,如果是说明是正常,如果峰值比较低,不到两倍,那有可能是缺失,但这样判断不精确,通常需要换一个位点再看.89c2051
深海贝类vitzj:
纯合性缺失,就是染体上的一对等位基因一起缺失;杂合性缺失,顾名思义就是只丢失了一条同源染体上的基因,另一条还在,通常如果另一条上的基因突变或者甲基化了就使基因彻底不能表达,如果发生在抑癌基因上就可能导致肿瘤.检测方法有FISH,str,和snpfish就不多说了,结果判断简洁明了,但贵,而且操作难度大.str一对同源染体上同一str位点的重复次数不一定相同,pcr扩增str全长,再跑胶,如果出现两条带,就说明该str位点是杂合子,假如你在肿瘤细胞中只看到一条带,那说明有杂合性缺失发生了.但如果该位点本来就是纯合子,那该位点被认为是信息不够丰富,需要结合其他位点来看,所以做str需要多个位点.从上面分析可以知道,如果没有正常DNA做对照,就算你跑出来全都是单峰,也不能说明问题,万一他就是个全纯合子呢?以上说得是跑page胶的方法,用测序仪做会简单些,但原理一样的.结果判断上面的帖子讲了.snp原理也类似,不多说了自己的电脑不在身边,只能大概相关地推荐你看看.Genome-Wide Genetic Characterization of Bladder Cancer: A Comparison of High-Density Single-Nucleotide Polymorphism Arrays and PCR-based Microsatellite Analysis这篇文章讲到了检测杂合性缺失比较常用的方法snp和str做snp可能需要MGB探针,会贵些,做str如果你有测序仪就比较方便.如果没有的话就pcr再跑page胶,麻烦但很便宜
滤纸片法
纯合性缺失,就是染体上的一对等位基因一起缺失;
轮毂材料杂合性缺失,顾名思义就是只丢失了一条同源染体上的基因,另一条还在,通常如果另一条上的基因突变或者甲基化了就使基因彻底不能表达,如果发生在抑癌基因上就可能导致肿瘤.
这个说法不太准确吧,杂合性丢失,
是vitzj 所说的丢失了一条,一对抑癌基因丢失了其中之一,变成了杂合子,这是第一次突变,一般发生在出生前,后来再发生第二次突变时,就是杂合子变成了纯合子,也就是杂合性缺失,抑癌基因缺失,与肿瘤的发生相关。指肿瘤基因组中特定染体上的某种DNA多态标记的等位基因片段,由同一患者正常组织基因组的两种变成一种,即等位基因型由杂合子变成纯合子.而不是丢失了一条同源染体的基因。其实这个也就是肿瘤发生学中的“二次突变学说”
>黄油嘴

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