空间转录组是通过提取生物样本中RNA的总体,进行转录组测序,研究某种生物体或组织的基因表达情况和转录本组成的技术。其基本步骤如下: 1. 样本采集与RNA提取:根据需要,对目标生物体或组织进行采集,并提取总RNA,并且保证RNA的质量。
2. RNA的修饰:进行RNA降解、去除rRNA等修饰,可以让RNA基因组中不含有任何噪声或与生物体相关性不大的转录体,进一步减少后续实验的误差率。
3. RNA片段化:将RNA通过加热或加酶等方式进行片段化处理,以便于后续步骤的操作。
视觉定位系统>电子管功放机 4. cDNA合成:即将RNA片段使用反转录酶进行反转录,合成cDNA。静音冷却塔
5. cDNA片段连接:将cDNA片段连接到接头序列之后,形成具有接头序列的cDNA文库。 6. cDNA文库深度测序:使用高通量测序仪对cDNA文库进行深度测序,产生巨量RNA序列数据,用于下游的数据分析。
7. 数据处理和分析:对测序数据进行去除低质量序列、去除接头序列、校正序列质量等处理,之后再对序列进行比对到参考基因组,注释转录本甚至可以进行转录本组拼装,最终可以进行生物信息学数据分析。
人体塑化 总之,在空间转录组技术中,RNA的处理以及cDNA合成都是至关重要的步骤,而深度测序也是得到精确数据的关键。同时,数据的分析和处理在空间转录组分析中也具有重要意义。
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