核酸的提取及纯化

核酸的提取与纯化
一 DNA的提取与纯化
导游扩音器
(一)实验目的与主要原理
DNA存在于细胞核中。通过裂解组织与细胞,使细胞膜破碎,
暴露出DNA与蛋白质的混合物。此时,通过蛋白酶的消化,使
DNA与蛋白质进行分离,而后利用硅胶柱或者酚:氯仿法,去
除蛋白质,从而提取高纯度DNA。
(二)实验材料
蛋白质K(20mg/ml),裂解液(100mmol/l Tris(pH
8.0),500mmol/L EDTA(pH 8.0),20mmol/l NaCl,10% SDS),硅
胶柱,TE(10mmol/l Tris-HCl,1mmol/L EDTA(pH 8.0),0.5*TAE (20mmol/l Tris-乙酸,0.5mmol/l EDTA,pH 8.0),10*Loading buffer(50mmol/l EDTA,60%甘油,0.25%溴酚蓝,pH 7.0)。
(三)实验方法
DNA提取的方法目前主要有两种,一种是利用酚:氯仿抽提的方法,另一种是利用硅胶柱吸附的方法。其中酚:氯仿抽提法由于试剂具有较强的腐蚀性和毒性,且对环境污染较大,目前使用者较少。而硅胶柱的方法操作比较简单,且毒性很低,对环境的影响较少,故而被广大实验者所使用。目前硅胶柱的生产厂家较多,以沉淀方法较为多见,主要步骤如下。
1 样本前处理
哺乳动物细胞:提前准备55℃冰浴。
(1)对于贴壁细胞,用胰蛋白酶或其他方法收集细胞,对于悬浮细胞,直接收集细胞。用PBS洗3次。
(2)加入3倍体积的裂解液,加入蛋白液K终浓度达到500ug/ml,37℃孵育4~6小时。
动物组织:提前准备55℃,70℃水浴。
(1)将25mg动物组织切碎,置于一无菌的1.5ml离心管中(注意,尽量越碎越好)。
(2)加入150~200ul的裂解液(含500ug/ml的蛋白酶K),55℃孵育直至完全裂解,(因组织不同而异,鼠尾6~8h,可以
过夜裂解,每小时颠倒2~3次)。
(3)如果需要去除RNA,可以加入适量Rnase A于样品中,室温孵育2min。
(4)12000r离心5min,转移上清于一无菌的离心管。
2 DNA提取过程采集程序
(1)利用2倍体积无水乙醇和1/10体积的3mmol/L醋酸钠沉淀DNA(注意沉淀为DNA,不能弃去)
(2)将上述混合物加入硅胶柱中,12000r离心1min,后用75%的乙醇清洗杂质,洗2~3次。
(3)将硅胶吸附柱置于干净的离心管中,在柱的中央加入200ul预热TE(60℃),或去离子水(pH)7.0),室温静
置1min,12000r离心1min,洗脱DNA。洗脱出的DN
A置于-20℃保存。
3 琼脂糖凝胶电泳
(1)1%琼脂糖的配制:例如:0.15g琼脂糖+15ml 0.5*TAE 微波炉加热至沸腾,待降低至70℃加入Gold view
染料(5ug/100ml),倒入小型胶槽中(其他规模胶槽
按此比例配制)。室温静置40min。
(2)取50~100ng DNA,用去离子水补充体积至10ul,加入1ul 10*DNA loading Buffer,进行电泳。电泳 120V
20~30 min(电泳液 5*TAE)
(四)注意事项
1 裂解液与样品的比例要适当,过少的裂解液可能导致样小便冲洗阀
本裂解不完全,而过多的裂解液也会影响提取效果。
2 尽量切碎组织,以免影响裂解效果;完全裂解后可以呈
茶子粉
粘稠状。
3 组织标本一般要保存在-80℃冰箱或液氮中,且避免反复
冻融;使用无菌离心管和头,避免DNA酶污染。一.RNA的提取与纯化
(一)实验目的与实验原理
RNA的提取方法有很多种,其中Trizol试剂提取RNA是目前常用的方法之一。Trizol是由苯酚和异硫氰酸胍配制而成,在匀浆和裂解过程中,Trizol可以裂解细胞、降解细胞其他成分,但同时保护RNA,抑制RNA酶活性。在氯仿抽提后,RNA存留在水相中,用异丙醇可以将其沉淀,最后得到RNA。
(二)实验材料
Trizol,氯仿,DEPC水,DEPC水配制75%乙醇,10*MOPS
缓冲液(0.2mol/L MOPS,80mmol/l NaAc,10mmol/l EDTA
Na2),1*MOPS电泳缓冲液(10*MOPS 150ml,37%甲醛80ml,
加水至1500ml),10*RNA上样缓冲液(50%甘油,1mmol/l
EDTA,0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青)。
(三)实验步骤
1 RNA的提取
(1)25cm*25cm培养瓶细胞+1mlTrizol(吹打使之充分裂
解);100ml组织+1mlTrizol(超声破碎仪破碎细胞使之充
分裂解),注:6孔板:加0.5mlTrizol。
(2)收集后转入0. 5mlEP管,加200ml氯仿。
(3)颠倒混匀至氯仿完全混匀,室温2~3min(发现液面
分为两层,上层为清亮,下层为红)。
(4)离心:4℃,12000r,10min.
(5) 转上层水相到1.5EP管,尽量避免吸取中层蛋白质
层。注:上层为RNA;中层为蛋白;下层为DNA。
(6)等体积异丙醇(400~500ul),充分混匀,冰浴10min。
注:如果组织很少,为了增加RNA提取的量,可以将异丙
醇-20℃预冷。
(7)离心:4℃,12000r,15min.
(8)弃上清,管底可见白沉淀,即为RNA。
(9)加1ml75%乙醇(DEPC水配制),离心:4℃,
12000r,5min。
(10)弃上清,加1ml 75%乙醇(可根据实验要求省略)。
(11)离心:4℃,12000r,5min,弃上清。
(12)短暂离心1min,吸出残留乙醇,室温晾干5min
氧化锆全瓷
(20~25℃)。
(13)加入30~40ul DEPC水,立即用于逆转录或置于75%
乙醇中保存于-80℃冰箱。
2 RNA甲醛变性琼脂糖凝胶电泳
(1)配置1.2%甲醛变性琼脂糖凝胶(20ml)
琼脂糖0.24g
无Rnase水17.4ml
10*MOPS    2.0ml
37%甲醛0.6ml
将琼脂糖加热融化后,加入10*MOPS,待胶冷却至60℃
左右,加入甲醛倒入胶板。65℃ 5min,冰上骤冷,加入
0.5~1.0ul的溴化乙锭(1.0mg/ml),将配好的1.2%甲醛
水银滑环
变性胶先在1*甲醛变性胶电泳缓冲液中预电泳15min。
RNA样品在5~10V/cm的电压电泳30min。
(四)注意事项
1 动物组织需在-80℃或液氮保存,且在实验过程中避免冻
融。

本文发布于:2024-09-24 00:18:14,感谢您对本站的认可!

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