全长cDNA酶切和连接体系

用测序时所构建的各片段重组质粒作模板,用新合成的加有连接酶切位点的引物扩增出需要连接的各片段。LF1在扩增时,由于片段比较长,故分为两步进行扩增,第一步扩增后,连接到pMD-18T载体上,再用此作模板进行第二次扩增。得到所需的加有酶切位点和启动子序列的目的片段,再将其克隆到pMD-18T载体上。使用时每次从载体上切取目的片段进行连接。
F5、F6和F7片段的连接,F5(Not I/ Fsp I)、F6(Fsp I/Csp45 I)、F7(Csp45 I/Sal I)分别进行酶切,将载体pGEM5zf同时进行Not I/Sal I双酶切,分别将各酶切产物进行纯化回收。由于F5片段和载体pMD18-T大小相近,故无法回收酶切后的目的片段,所以F5片段直接采用PCR产物进行双酶切。各片段的酶切体系如下:
灭菌去离子水
4.3µl
10×buffer
2µl
BSA
0.3µl
DNA
12µl
酶1
0.7µl
dmm1酶2
0.7µl
37℃,酶切3h,回收各酶片段。20µl酶切体系
酶切buffer F5用buffer D、F6用buffer B、F7用 buffer D
F21和F22的连接,将F21和F22 PCR测序片段分别用Nhe I酶切后,回收目的条带,将二者用T4 DNA酶连接后,克隆到T-easy载体上。即为连接全长所用的F2片段。连接时,直接用设计时的两端酶切位点。
LF3和LF4同样用Acc III酶切后,用T4 DNA连接酶连接,再克隆到pMD-18T载体上,用于5’半长的连接。
F21、F22连接酶切体系:
Nhe I    1µl;10×M buffer    2µl;DNA    17µl;
F3、F4连接酶切体系:
Acc III  1µl;10×F buffer    2µl;BSA    0.2µl;DNA    16.8µl。
37℃ 3h酶切。纯化回收时,注意各种限制性酶的灭活(65℃,10min)。
连接体系:
T4 DNA连接酶buffer 2µl;T-easy(F2) or pMD-18T(F34) 2µl;回收DNA片段15µl;T4 DNA连接酶 1µl。16℃ 6h,再4℃过夜。转化感受态JM109。
5’半长cDNA酶切体系:
pGEM-5zf(+)
F1片段
F2片段
F34片段
体系
40µl体系
30µl体系
40µl体系
40µl体系
灭菌水
2.4
4.0
2.4
2.4
10×buffer
Buffer D
4
Buffer D
3拉丝模
Buffer D
4
Buffer D
4
BSA
0.6
0.6
0.6
0.6
DNA
30
20
30
30
酶1
Not I
1.5
Not I
1.2
Pvu I
1.5
Nsi I
1.5
酶2
Sal I
1.5
Pvu I
1.2
Nsi I
1.5
Sal I
1.5
5’半长连接体系
20µl
10µl
T4 DNA ligase
1.1
0.5
10×buffer
2
1
F1
5.3
2.7
F2
5.3
2.7
F34
5.3
2.7
pGEM-5zf(+)
1
0.4
16℃,过夜,次日4℃保存至闪日下午转化。
全长连接时的5’半长与3’半长酶切体系
温泉浴片麦饭石杯
40µl体系
5’-half
陈皮酱
3’-half
10×D buffer
4
4
灭菌水
2.4
2.4
BSA
0.6
0.6
DNA
30
30
酶1
Not I
1.5
Spl I
1.5
酶2
Spl I
1.5
Sal I
1.5
37℃ 3h。
远距离遥控器
酶切后纯化回收时,依据连接时DNA的用量,最后一步适量入无核酸酶水。
全长连接体系:20µl
T4 DNA连接酶  1µl
10×buffer      2µl
5’-half          8µl
3’-half          8µl
pGEM-5zf(+)      1µl
16℃连接6小时后,4℃放置过夜,次日下午转化。分别取10µl转化一管感受态JM109。涂板,挑斑,鉴定。

本文发布于:2024-09-22 07:28:25,感谢您对本站的认可!

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