全血DNA的提取及PCR-RFLP技术的应用

全血DNA的提取及PCR-RFLP技术的应用
2014级医学检验技术15班4组  201440045
摘要以肝素钠抗凝的全血为材料,以常规的酚氯仿抽提法为基础,采用改进的方法提取基因组。结果表明,提取的基因组纯度高,用琼脂糖凝胶电泳检测基因组主带清晰、无拖尾现象;利用PCR-RFLP技术对人外周全血遗传性疾病的已知突变检测。
关键词:PCR—RFLP;全血基因组DNA提取
从外周血中制备高分子量 DNA 是进行分子水平研究的先决条件之一[ 1] 。不同的DNA提取方法有各自不同的缺点。目前实时荧光定量PCR技术广泛应用,其定量性能主要取决于样本核酸的提取效率、引物的序列,以及扩增反应的条件。试剂盒法因简便、快速、高效而常被实验室使用,其中主要成分细胞裂解液用量大、单价比较贵,而其他试剂成分又有剩余,弃之可惜。经多次试验并查阅和参考其他资料,我们通过改用O.2%NaCl裂解红细胞收集全血中的白细胞,用5mol/L KI裂解白细胞膜替代试剂盒中的细胞裂解液,再用试剂盒提取基因组DNA,可以获得更多的高质量的基因组DNA,其纯度能满足后续分子生物学实验的需
要,是一种适于临床检测及分子生物试验,安全无毒、经济、快速有效的提取基因组DNA的方法。
材料与方法
1 全血样品 利用眼眶取血的方法, 取人外周全血血液1 ml ,以肝素钠抗凝
2 全血DNA提取方法
(1)离WBC1ml 全血,等体积3%明胶,颠倒混匀2-3min37静置,5-10min,取上清(新管),4000r/min 离心 ,代码转换5min,弃上清。
(2)破碎WBC 加入2ml TES ,轻轻敲击管底震荡混匀,加1010%SDS,颠倒混匀
      (3)抽提DNA加等体积Tris饱和酚,颠倒混匀,100次, 4000rpm,离心5min取上清,加等体积氯仿:异戊醇(24:1),颠倒混匀,1004000rpm,离心5min,将上清移入5ml试管
(4)沉 淀DNA  加2.5倍体积无水乙醇,颠倒混匀,至有絮状沉淀产生,吸出絮状沉淀到1.5
mlEP管,开盖通风橱内放置5min,挥干至,无残余液体,加入100μІ ddH2O溶解
3、PCR扩增
PCR反应体系如下:
功率测量
RFLP方法用Msp酶对PCR产物进行酶切分析, DNA 进行扩增, 反应体系为 20μl :10×Buffer 2μl;MgCl2(25mM)2μl;dNTP(2mM)2μl;引 物ITS1、ITS4[5](10μM)各1μl; TaqDNA聚合酶(1U/1μl)1μl;DNA模板1μl; 去离子水10μl。反应条件 :94预变性 5min;
94 30s,56 30s,7230s,35 个循环 ;72延伸 10min。
4、聚丙烯酰胺凝胶电泳操作步骤如下
废矿物油⑴ 制胶:准备好用于灌胶的玻璃板和间隔条,按照说明安装好制胶架,然后按照下表灌胶
⑵ 倒胶
将胶灌于两槽之间,立即插入梳子(勿使梳齿下有气泡),室温下凝胶后,垂直拔出梳子。用电泳缓冲液冲洗加样孔。
(3)装槽
    约30分钟后,胶凝固,可装配电泳槽,待上样
(4)上样
      酶切产物直接上样(不用加溴酚蓝)
(5)电泳
    1×TAE为电泳缓冲液,130V,电泳1h 
5、银染
操作步骤如下:
10%乙醇固定5min,1%硝酸氧化3mi;ddH2O洗凝胶1min;0.012mol/L AgNO3溶液,20min;ddH2O洗凝胶1min;0.28mol/L NaCO束线带3,0.019% 甲醛显;10%冰乙酸 2min,停止还原反应;ddH2O洗凝胶2min以上。
结果
本次结果为:野生纯合型(第7条带)
讨论
分子生物学中提取 DNA 的标本种类很多[ 6 10] ,本组采用的是外周血白细胞细胞核中的核蛋白提取DNA 制备 DNA 的原则是既要将蛋白质脂质 多糖及小分 子杂 质分 离干 净 , 又 要得 到高 分子 量的DNA[ 1] 最早的经典分离方法是 BlinStafford改良建立的碘酚-
氯法[ 5] ,投票箱制作虽然可提取高分子量的 DNA ,但由于操作复杂 时间长 , 所以有学者对其进行改良后 ,使提取 DNA 的操作简化 ,时间缩短(6 8h), 成为现在普遍采用的微量法[ 3] , 但该法提取 DNA 时间仍然较长
PCR-RFL 分析方法具有一定特异性, 结果较稳定, 重复性较好,只需要一对引物、一种内切酶即可检测
参 考 文 献
1 王德宝. 核酸的结构 功能与合成(下册) . 北京 : 科学出版
, 1987. 387.
2 BlinN ,Brow n P O , Bo tstein D , et al. A general method forisolationo fhig h molecula r weight DN A f rom eukaryotes.Nucleic A cids Res , 1976 , 3(2): 2303.
3 碳海绵单可人 , 齐晓岚 , 谢渊, . 贵州黔西荔波少数民族全血
DN A 提取方法的探讨. 贵州医学杂志 , 2003, 27(11): 976-977.
4 萨姆布鲁克 J, 弗里奇 EF, 曼尼阿蒂斯 T , . 黄培堂, .分子克隆实验指南. 北京 : 科学
出版社 , 1993. 956.
5 卢圣栋. 现代分子生物学实验技术. 2 . 北京 : 中国协和医科大学出版社 , 1999. 80- 465.
6 G olenbergEM ,Giannassi DE , Giannassi, et al. ChcoroplastDN A sequence fro m a M iocene M ago lia species, Na ture,1990, 344(3): 656- 658.
7 Higuchi R ,Bow man B, L und K , e t al. DN A sequence s fromthequagga, an e xtinct member of the horse family. N ature,1984 , 312 : 282 - 284.
8 Higuchi RCH ,von Beroldingen. DN A typing f romsinglehairs . N ature,1988 , 332 (4 ) : 543 - 546.
9 Ielaw ski K ,Bielaw ski K , Zaczak A , et al. T he suitability ofD NA extracted f rom formalin - fixed , paraffin - embedded tis -sues for double differential polymerase chain reaction analysis. Int J M ol M ed, 2001 , 8(5): 573 - 578.
10 童大跃, 伍新尧, 陆惠玲 , . DN A 提取方法的比较及改良 . 中山大学学报 医学科学版, 2003 , 24(4): 411 - 412.
11 陈悦 , 张宝珠. 一种新的 D NA 提取方法 — — — T LS . 中国优生与遗传杂志 , 1999 , 7(3): 37.

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