实时定量荧光PCR法检测清真食品中狐狸源性成分

工业技术
科技创新导报 Science and Technology Innovation Herald
109
DOI:10.ki.1674-098X.2017.36.109
实时定量荧光PCR法检测清真食品
贾冰凝  何微  岳苑  吴明  张慧玲
(宁夏回族自治区食品检测中心  宁夏银川  750001)
摘 要:根据狐狸线粒体DNA(mtDNA)序列设计了狐狸特异性引物和探针,建立了食品中狐狸源性成分的实时荧光PCR检测方法。该方法的检测灵敏度可达0.1pg,而且与常见的12个物种无交叉反应,可作为食品中狐狸源性成分鉴别的有效方法。关键词:实时荧光PCR  狐狸源性  线粒体DNA  清真食品中图分类号:TS207              文献标识码:A  文章编号:1674-098X(2017)12(c)-0109-03
我国少数民族众多,遍布各个省份,其中回族、维吾尔族、哈萨克族等少数民族信奉伊斯兰教。他们在饮食、起居等方面形成了独具特的风俗习惯,尤其在饮食方面有着严格的宗教特禁忌,禁食奇形怪状、污秽不洁、性情凶恶、行为怪异的飞禽、猛兽及鱼类等食物以及不反刍的动物,如猪、狗、猫、鼠、蛇、驴、马、骡、狗、狐狸等[1]。
狐狸作为一种经济附加值很高的畜类,在中国广泛养殖,人们主要通过饲养狐狸获取其皮毛制作衣服、围巾等产品。在将狐狸剥去皮后,剩余的肉及内脏就成为了“废物”,一些不法商贩将废肉低价买入再将其送往食品加工厂做成牛肉、羊肉、狗肉等制品并高价卖出,从中获得暴利。由于狐狸肉没有通过检验检疫,带有大量的病毒、细菌、寄生虫,而且为了得到光泽好的高质量的皮毛,养殖户会给狐狸喂食激素。这不仅仅是食品安全问题,更涉及到人们身体健康和宗教信仰等问题[1]。因此,对于肉制品中掺假的检测显得尤其重要。
动物源性检测手段主要有蛋白分析法和核酸分析法,但由于蛋白分析法要求样品不能经过高温等能使
蛋白变性的烹饪手段,这就极大地限制了其在实际生活中的应用[1]。随着分子生物学的进步,PCR技术很好地解决了这一问题。实时定量荧光PCR可以实时检测目标片段的表达情况,是目前检测食品中动物源性成分的主要手段,它有着专一性强、对样品加工程度要求低等特点[2]。目前已有关于猪、牛、羊、马、驴、兔[4-5]动物源性成分分析的报道,但采用实时定量荧光PCR法检测清真食品中狐狸源性还鲜有报道。本实验选择狐狸线粒体设计引物和探针,建立快速准确地检测清真食品中狐狸源性成分的实时定量荧光PCR检测方法,给食品掺假检测以及规范清真食品市场提供参考。
1  材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样品及来源
肉及其制品包括牛、羊、猪、鱼、鸡、鸭、鹅、鸽子、鹌鹑、驴、马、狗、狐狸。猪、牛、羊、鱼、鸡、鸭、鹅、鸽子、鹌鹑采购自超市,驴、马采购自餐馆,狐狸采购自银川市西夏区兆狐狸养殖合作社,犬血液购自银川市兴庆区宠康动物诊所。
1.1.2 实验试剂
基因组DNA提取试剂盒购自于大连TA K A R A公司; PCR扩增纯化试剂盒,购自于Promager公司。
1.1.3 实验仪器
实时荧光定量PCR仪(Ep p e ndor f公司);高速冷冻离心机(日本HTACHI公司);恒温加热器(HAITEC公司)。
1.1.4 引物及探针的设计
根据NCBI基因数据库中公布的基因数据,选择狐狸细胞素b基因[3],在线粒体DNA的区域设计了用于检测狐狸DNA的特异性引物和探针,此外,为了防止假阴性结果的出现以及监控PCR反应的正常与否,在真核生物的16sRNA保守区域设计了通用上下游引物。引物及探针的序列见表1。1.2 方法
1.2.1 样品DNA的提取
采用TA K A R A公司基因组DNA提取试剂盒,具体步骤:
(1)称取10mg样品加入Ep管中,充分剪碎;(2)70℃加热10min,其间指弹2~3次;(3)12000rpm、4℃离心10min,取200μL上清于新离心管中备用。阴性样品同样通过该法提取DNA,溶解于100μL TE溶液中备用。
1.2.2 实时荧光PCR反应
①基金项目:宁夏回族自治区重点研发计划(科技惠民)项目(项目编号:2016KJHM133)。
作者简介:贾冰凝(1968—),女,宁夏吴忠人,本科,高级工程师,研究方向:食品微生物检测与动物源性成分分析。
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反应体系40μL:PCR Mix25μL,上游引物(10μM)1μL,下游引物(10μM)1μL,探针(5μM)2μL,模板DNA(10~50ng)2μL,无菌水补至40μL。
反应条件为:50℃保温2m i n,95℃预变性2m i n,95℃变性15s、60℃延伸45s进行40个循环,同时扩增目标物和内参。
1.2.3 特异性实验
为了考察本研究特异性,取1.1中所有样品的制作模板。根据1.2.2的反应体系和反应条件分别扩增。通用引物同步扩增[5]。
1.2.4 灵敏度实验
将狐狸D N A 溶液稀释至10%、1%、0.1%、0.01%、0.001%、0.0001%、0.00001%,以含量不同的狐狸DNA样品为模板,进行PCR反应,用于确定方法的灵敏度。
1.2.5 重复性与稳定性验证
将狐狸DNA作为模板,按照1.2.2所述的反应体系与反应条件进行扩增,同一模板进行7次扩增反应,研究所建立体系的稳定性。
2  结果与讨论
2.1 狐狸源性成分特异性分析
用设计的狐狸源性引物和探针分别对12种样品的DNA 进行实时荧光P C R,结果如表2所示,C t 值的平均值为15.16,其余物种均无扩增,由此可见本研究所设计的狐狸源性引物和探针特异性良好。2.2 灵敏度试验结果
用特异性的引物和探针,以狐狸DNA含量分别为10%、
种类
引物和探针序列
片段长度
狐 狸
sense primer
5`-tggagcatcagtagaccttacaattt-3`109bp antisense primer
5`-ggcgggaggttttatattgataatag-3`probe FAM-ccctgcacctggccggagtc-TAMRA
通 用
sense primer
5`-gttcgtttgttcaacgattaa-3`74bp antisense primer
5`-agatagaaaccgacctggat-3`probe
FAM-ctccggtctgaactcagatcacgta-TAMRA 表1  狐狸源性引物和探针
表2  狐狸源性成分实时荧光PCR特异性试验结果
表3  狐狸源性成分重复试验结果
DNA含量由左至右依次为10%、1%、0.1%、0.01%、0.001%、0.0001%和0.00001%
图1  狐狸源性成分灵敏度试验
模板空白牛羊猪鱼鸡鸭鹅鸽鹌鹑马驴狗狐狸Ct
15.16
123.4567平均值标准差变异系数Ct值
15.36
15.07
15.53
14.81
14.85
15.04
15.24
15.13
0.26
1.74%
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1%、0.1%、0.01%、0.001%、0.0001%和0.00001%为模板扩增,结果见图1和图2。由图1和图2可知:当狐狸成分含量低至0.0001%时,仍能够呈现S型扩增曲线并且Ct值<35,说明本方法可检出10-4n g的DNA量,因此方法的灵敏度为0.1pg。在10%至0.00001%浓度范围内,建立Ct值-DNA含量的标准曲线,R 2
为0.996,线性相关度良好。2.3 重复性与稳定性试验结果
狐狸源性成分重复性试验结果Ct值见表3。经统计学分析表明,实验稳定性和重复性良好,结果无显著性差异。
3  讨论与结论
3.1 目的基因的选择
之所以会选择线粒体细胞素b,是因为狐狸的细胞素b相对使用其余DNA片段作为物种鉴定的靶序列具有以下优点:(1)细胞素b 具有广泛的种内和种间多样性,比核DNA进化速度快,适于亲缘相近
物种的鉴别。(2)每个线粒体含2~6个环状DNA,在数量上远超过核DNA,适于加工样品的分析。(3)细胞素b在不同的物种中具有较高的变异性,特异性较强。3.2 检出限的确定
狐狸源性成分灵敏度试验0.1%、0.01%含量检测的Ct值均<35.0,但是为了区分偶然性和蓄意掺假,同时考虑检测过程中的实际意义,将检出限确定为0.1%。
参考文献
[1] 岳苑.实时荧光PCR法检测清真食品中马、驴源性成分
Slope:3.165    Y-Intercept:5.51    Efficiency:-0.52    R
2=0.996
图2  Ct值-DNA含量的标准曲线
[J].湖北农业科学,2014,53(22):5519-5521.
[2] 陈茹,林志雄,刘琳琳.应用PCR等核酸技术检验动物饲
料中牛羊组织成分[J].中国兽医科技,2001,31(9):3-8.[3] 曹际娟,卢行安,秦成,等.实时荧光PCR技术
检测肉骨粉中
牛羊源性成分的方法[J].生物技术通讯,2002,13(2):158-160.
[4] 杨宝华,宗卉.根据线粒体基因的特异性鉴别检测饲料中
的动物源性成分[J].科学试验与研究,2000(5):1-3.[5] Wang Q,Zhang X,Zhang HY ,et al.Identification
of 12 animal species meat by T-RFLP on the 12S rRNA gene[J].Meat Science,2010,85(2):265-269.
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