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mirna靶基因分析This document is for reference only-rar21year.March
靶基因功能的显著性分析——GO-Analysis
研究靶基因在Gene Ontology中的分布状况将阐明差异microRNA的靶基因在功能上的体现。GO-Analysis对靶基因按GO分类,并对分类结果基于离散分布的显著性分析、误判率分析、富集度分析,得出与靶基因有显著联系的、低误判率的、靶向性的基因功能分类。对显著差异的microRNA调控的靶基因参与的功能显著性体现,揭示靶基因从功能上揭示羊皱胃粘膜miRNA在捻转血矛线虫感染中的作用机制。 MicroRNA与基因的调控网络——MicroRNA-Gene-Net 将显著性功能所包含的靶基因与microRNA构建调控网络。而后,根据网络中microRNA的位置函数计
算出microRNA在网络中的关系强度,即microRNA的网络特征值。特征值最高microRNA处于网络的枢纽性地位,该microRNA调控能力最强,对网络结构和样本性状有重要的调控价值,同时从网络中也可以得到被microRNA调控的关键靶基因。这里取差异microRNA,构建microRNA与基因的调控网络,根据构建的microRNA与基因的调控网络,得到网络中具有重要调控地位的microRNA和被调控的关键的靶基因,揭示miRNA在捻转血矛线虫感染中的调控网络。结果样式如下: