做好westernblot需要注意各种细节,转给需要的你!

做好westernblot需要注意各种细节,转给需要的你!
忘记从哪⾥转载来的⽂章了,并做了部分改动。⾸先对作者表⽰深深的歉意,如果将来作者本⼈认领了,请及时留⾔或联系,我必将标注来源。
做好Western需要注意各种细节。⼯欲善其事,必先利其器,⾸先还是从蛋⽩提取开始谈起。
壹:蛋⽩提取
⼀、细胞蛋⽩的提取三角形算法
1.收样前3min先配制细胞裂解液(现配现⽤),RIPA:蛋⽩酶抑制剂:磷酸酶抑制剂=99:1:1。6孔板收集蛋⽩每孔需200ul,计算⽤量。以收集六孔蛋⽩为例,按⽐例加⼊RIPA 1200ul,蛋⽩酶抑制剂12ul,磷酸酶抑制剂12ul,混匀后置于冰上。(我使⽤的试剂RIPA裂解液(中),蛋⽩酶抑制剂混合物(100×),蛋⽩磷酸酶抑制剂混合物(100×)均购⾃***公司)
2.弃掉旧的培养基,PBS洗三遍。
3.每孔加⼊200ul刚配好的裂解液,⽴即置于冰上,在摇床上裂解30min。
4. 30min后在冰上将6孔板中的细胞收集⾄EP管中(尽可能多地刮掉细胞)。
5. 14000g,15min(4℃)离⼼,取上清于EP管中即为提取的蛋⽩(最好⽤进⼝Axygen EP管,后⽂解释原因)。
注:2~4步也可先⽤胰酶收集细胞,离⼼,PBS洗三次,再向EP管中加⼊裂解液,置于冰上摇床裂解30min。我也尝试过这种⽅法,相⽐⽽⾔,上⼀种⽅法简便并节约时间,但可能会损失⼀些细胞,可根据实际情况选择。
⼆、组织蛋⽩的提取
(全程在冰上操作)
1.将动物组织(脑、肺等)取出后分装成三份或更多(⼀份WB,⼀份qPCR,⼀份备⽤),取出后⽴即存于-80℃。(注:取完⼀块组织后⽴即冻存于-80℃,反复冻存样品对待测蛋⽩有影响,最好⽤新鲜样品实验)
3g无线摄像机2.配制细胞裂解液(现配现⽤),组织:RIPA=1mg:10ul,可根据实际情况调整。RIPA:蛋⽩酶抑制剂:磷酸酶抑制剂=99:1:1。配好后置于冰上。
3.将其中⼀份组织剪下约90mg于有钢珠的震荡匀浆器中匀浆。此匀浆器的盖⼦或芯通常置于-20℃,使⽤时取出,操作应快捷,匀浆1min基本可保持温度。
4.将匀浆加⼊90ul现配的裂解液中,冰上摇床裂解30min。
5. 14000g,15min(4℃)离⼼,取上清于Axygen EP管中即为提取的蛋⽩。
贰:蛋⽩浓度测定
我采⽤的是***公司的BCA蛋⽩定量试剂盒测定提取蛋⽩浓度,和说明书protocol差别不⼤,稍有不同,如下:
1.稀释BSA标准品以制作标准曲线:取7⽀EP管,每管加30ul⽣理盐⽔,第⼀管加30ulBSA,混匀后再取30ul⾄第⼆管,依次倍⽐稀释,最后⼀管不加为空⽩(即本底值)。则8个标准品的浓度分别为2ug/ul、1ug/ul、0.5ug/ul、0.25ug/ul、0.125ug/ul、0.0625ug/ul、
0.03125ug/ul、0。
2. 5倍稀释样品蛋⽩:取六⽀EP管(6个样品),各管加40ul NS,再分别取10ul样品在各管中稀释。
3.将8个标准品和稀释待测样品各加25ul于96孔板中。
4.配制BCA⼯作液:每个样品做2个重复,再加上8个标准品,⼀共20个孔,按22个孔算,以防加样损失。则需A液:
200ul×22=4400ul,B液:4400ul/50=88ul,计算好所需体积后在⼀⼲净试管中将A、B⼯作液混匀。
6.混匀后⽴即向各孔中加⼊200ul配制的BCA⼯作液,37℃孵育30min。
7.酶标仪562nm下测定各样品和BSA标准品的吸光度值,作出标准曲线,计算出待测样品的浓度。
8.根据各样品浓度计算1×loading buffer体积,将各样品浓度调为⼀致;并计算5×loading buffer的体积,加⼊各管中。混匀后沸⽔煮
15min,冰上分装,存于-20℃。
Tips
1.前⾯提到收集蛋⽩于进⼝Axygen EP管中,是为了防⽌煮沸蛋⽩时EP管盖⼦弹开,液体溅出⽽改变蛋⽩浓度。
2.关于分装体积,我提取的细胞蛋⽩调整浓度后约为1.5ug/ul,每次电泳上样20ul,所以分装体积每管50ul,⼀次或两次电泳即可⽤完,避免
反复冻融。
叁:Western Blot
⼀、WB所需试剂
可提前配制:
1. 10×电泳缓冲液:
配制250ml 10×电泳液作为母液,依次称取Tris 7.5g,⽢氨酸36g,SDS 2.5g,加双蒸⽔⾄250ml,常温保存。使⽤时⽤蒸馏⽔稀释⾄1×。
2. 1×电转液:
u交配制500ml 1×电泳液,依次称取Tris 2.9g,⽢氨酸1.45g,SDS 0.185g,加双蒸⽔400ml,待都溶解后再加⼊100ml甲醇,常温保存。
配制的电泳液和电转液可供多次Western使⽤。
注意:1.最后加⼊甲醇,若先加甲醇,Tris、⽢氨酸和SDS不易溶解。
2.溶解较慢时可⽤磁⼒搅拌器加快溶解。
磁悬浮支架图片
现配现⽤:
分离胶、浓缩胶、5% BSA溶液(w/v)、5%⽜奶(w/v)、1×TBST洗液、⼀抗和⼆抗,在WB步骤中详细介绍。
⼆、WB pr o to c o l
(⼀)清洗玻板和⼩烧杯:
戴好⼝罩和⼿套,选⽤1.0mm玻板,⽤试管刷和洗洁精仔细刷洗玻板,清⽔冲洗⼲净。卡槽对齐卡好后置于软橡胶垫⽚上,夹紧,向板中加满蒸馏⽔试板⼦是否漏液。观察⼏分钟后若不漏液,将板⼦中⽔倒出,倒扣晾⼲。
(⼆)配胶:
1.配制8ml 10%分离胶,依次向⼩烧杯中加⼊蒸馏⽔3.04ml,30%丙烯酰胺
2.7ml,1.5M·pH8.8 2.0ml,10%SDS 80ul,10%AP
80ul,TEMED 3.2ul。加⼊TEMED混匀后⽴即灌胶,⽤1ml头沿着玻板上沿从左⾄右轻轻将胶打⼊,
以免胶浓度不均匀,避免⽓泡产⽣。加完后换200ml头从左⾄右更加⼩⼼加⼊蒸馏⽔⽔封,以免冲散刚灌的分离胶。静置,当⽔和胶之间出现⼀条⽔平的折线时,即已凝固。
2.待分离胶凝固后,将⽔封的蒸馏⽔倒出,可将滤纸条放于玻板⾓吸⽔加快残留⽔流出,倒置。配制4ml 5%分离胶,依次向⼩烧杯中加⼊蒸馏⽔2.7ml,30%丙烯酰胺670ml,0.5M·pH8.8 500ul,10%SDS 40ul,10%AP 40ul,TEMED 4ul。加⼊TEMED混匀后⽴即灌胶,同上⽤
1ml头从左⾄右轻轻加⼊浓缩胶,加满后冲洗10孔梳⼦,⽔平轻轻插⼊浓缩胶中静置待其凝固。可将剩余的浓缩胶沿着梳⼦加⼊玻板中以完全密封。
3.此时,可将之前分装好的煮过的加⼊loading buffer的蛋⽩样品、预染的蛋⽩maker 和⼀⼩⽀loading buffer 置于4℃融化。
Little Trick
1.AP和TEMED均为神经毒性、致癌物质,使⽤时需⼩⼼。
2.灌胶时视线与胶⾯⽔平,注意操作,避免胶溅⼊眼睛中。
3.常温下半⼩时胶可凝固,若天⽓寒冷或需加快凝固,可将其置于37℃孵箱中,15min左右即可凝固。
4.若第⼆天早上⽴即跑胶,这样就不耽误午饭时间,可头天晚上先把胶配好,凝固后取下玻板,连夹⼦、梳⼦⼀同放⼊蒸馏⽔中,4℃过夜保存。
(三)电泳:
1.将玻板卡紧电泳槽中,先在内槽加满已配好的1×电转液,⼗⼏分钟后观察是否漏液,若漏液重新调整玻板,再次卡紧,直⾄不漏液为⽌。否则,可能胶还没跑完,电转液就漏完了。
2.轻轻拔去梳⼦,第⼀孔加⼊5ul预染的蛋⽩maker ,2~7孔依次加⼊20ul待测蛋⽩样品,第8孔加⼊10ul提前融化的loading buffer。上样时轻轻加⼊,注意不要将样品加⼊其他孔,或加样过快导致样品溢出。
3.插好正负极,注意检查正负极不能插反。调节电压⾄80V(浓缩胶),跑0.5h后;将电压调⾄100V(分离胶),约1.5h后,maker分离明显,在胶底部出现⼀条蓝⾊的buffer条带,此时电泳完毕。使⽤完在实验仪器使⽤本上做好登记。
注意:避免蓝⾊条带跑出分离胶,这样有可能⽬的蛋⽩也已经跑出,所以在分离胶底部出现⼀条整齐⽔平的蓝⾊条带时,即停⽌电泳。
Little Trick
1.电泳时插好正负极后,从电泳槽底会有⼩⽓泡上升,⽓泡的数⽬和上升速率与电压⼤⼩呈正⽐。若⼩⽓泡和往常不太⼀样,观察⼏分钟后还是如此,则需检查是否加错了电泳液,或者电泳液配制有误。
2.⼀般浓缩胶80V 0.5h,分离胶100~120V 1~1.5h,具体跑胶电压和时间与⽬的蛋⽩⼤⼩、实验仪器和实验室环境都有关,需多次探索最佳条件。若⽬的蛋⽩较⼩,则尽量缩短跑胶时间,并及时观察maker位置,避免⽬的蛋⽩跑出。我分别实验了浓缩胶80V 0.5h,80V 1h,分离胶120V 1.5h,120V 1h,100V 1.5h,100V 1h,110V 1.5h,110V 1h,结果显⽰在本实验室实验仪器下,我的⽬的蛋⽩及内参在浓缩胶
80V 0.5h,分离胶100V 1.5h条件下,分离效果最好。在此条件下,我做了⼏次重复实验,结果均⼀致。因此,总结出本实验室此⽬的蛋⽩的最佳电泳条件。
3.电泳的好坏直接影响到⽬的蛋⽩的显影情况,尤其时磷酸化⽬的蛋⽩的⼆聚体,若电泳条件优化,结果可清晰显出蛋⽩表达情况。所以探索最佳电泳条件是决定胜负关键⼀步。
4.电泳快结束时即可准备转膜所需的滤纸和PVDF膜,浸泡在电转液中。建议在第⼀次WB后分别剪好不同⼤⼩的硬纸⽚,标好⾯积和孔数(即样品数),存好以后随时使⽤。
5.WB中夹取PVDF膜最好使⽤平头镊⼦,并夹住膜左上⾓,可最⼤程度减⼩对膜上蛋⽩的损害。
(四)切胶:
电泳结束后,取出玻璃板,稍洗,洗净电泳槽,放好。轻轻撬开玻璃板,根据maker位置和⽬的蛋⽩分⼦量⼤⼩在玻璃板上切胶,为了防⽌切歪,可在玻璃板下垫上上述剪好的同切胶⼤⼩⼀致的硬纸⽚。⼀般⼀块胶需切下⽬的蛋⽩和内参两⼩块胶,将切下的胶分别浸泡在电转液中。
(五)转膜:
加工助剂acr
1.根据每⼀块切胶的⼤⼩剪6张同样⼤⼩的滤纸和⼀张PVDF膜,浸泡于电转液中,可以提前准备好的硬纸⽚为模板剪。PVDF膜先经甲醇活化20s 后浸泡于电转液中。
2.在电转仪上制作“三明治”结构转移膜,最下⾯放三层滤纸,然后依次放PVDF膜,胶,三层滤纸,⽤玻璃棒轻轻赶⾛⽓泡(注意上下三层滤纸之间不能接触,否则易造成短路)。盖上盖⼦,根据膜的总⾯积调整电流,电转2h。
3.在电转的同时,可以配制以下液体,事先根据膜的数量计算好所需体积:
以⼀块膜为例,封闭5ml+稀释⼀抗4ml+稀释⼆抗4ml,需要13ml,则配制15ml。
5% BSA溶液(w/v):配制15ml 5% BSA溶液(w/v),称取0.75g BSA晶体,溶于15mlTBST中,漩涡振荡器混匀,现⽤现配,4℃保存(若⽬的蛋⽩为磷酸化蛋⽩时配制)。
5%⽜奶(w/v):配制15ml 5%⽜奶(w/v),称取0.75g脱脂奶粉,溶于15ml TBST中,漩涡振荡器混匀,现⽤现配,4℃保存。
1×TBST洗液:使⽤时将100×TBST⽤双蒸⽔稀释⾄1×,常温保存。
Little Trick
1.关于电转膜,有些使⽤NC膜。我没有尝试过NC膜,但隔壁实验室使⽤NC膜多次WB结果仍不理想,换⽤PVDF膜后有所改善。因此建议还是使⽤PVDF膜,可购买Millipore的PVDF膜,⼀卷有些贵,但是可以够⼀个实验室⽤好⼏年哪。最好不要在经销商购买分装的的PVDF膜,另⼀实验室⼀同学想着价格便宜也就只做⼏次,就从试剂公司只买了100cm2的膜,结果这价格虚⾼不说,⽽且膜还是假的,直到做完实验了才发现,蛋⽩样品也浪费了。所以建议还是购买Millipore公司原装的PVDF膜。
2.关于电转⽅式,有些采⽤湿转,有些采⽤半⼲转,两种⽅式均可。个⼈觉得半⼲转⽅便简捷些。
(六)封闭:
1.电转结束后,根据maker位置和⽬的蛋⽩及内参⼤⼩剪膜。可在标有maker的⼀边左上⾓剪⼀个⼩⾓,以清楚哪⼀条带是1号样品。
2.分别⽤已配好的5% BSA和5%⽜奶封闭⽬的蛋⽩和内参,室温摇床上孵育2h。根据盒⼦⼤⼩,加⼊封闭液的量需没过膜。
(七)孵育⼀抗:
1.配制p-STAT1⼀抗(公司),1:500稀释,加⼊上述配制的5% BSA 4ml,再加⼊8ul p-STAT1⼀抗,混匀,现配现⽤。
配制actin⼀抗(公司),1:2000稀释,加⼊上述配制的5%⽜奶4ml,再加⼊2ul actin⼀抗,混匀,现配现⽤。
2.将PVDF膜从封闭液中取出,可⽤平头镊⼦⼩⼼放⼊塑料⼿套的⼿指中,加⼊⼀抗,封⼝,使膜完全浸泡在⼀抗中,放⼊冰箱,4℃过夜。我⼀
般⽤封⼝膜做成⼩盒,置于⼤玻璃平⽫中,放⼊PVDF膜,⽤从上到下向膜上加⼀抗,完全浸没,之后和PCR上样仪⼀同固定在摇床上,4℃孵育过夜。
(⼋)回收⼀抗:硅料回收
次⽇,回收⼀抗,做好标记,-20℃保存,可再使⽤3~4次。将膜放⼊1×TBST中,摇床上清洗三次,每次10min。
(九)孵育⼆抗:
1.配制具有种属特异性的HRP标记的⼆抗(抗⿏或抗兔),1:2000稀释,加⼊上述配制的5%⽜奶4ml,再加⼊2ul ⼆抗,混匀,现配现⽤。
2.TBST洗完膜后,加⼊⼆抗,室温摇床上孵育2h。
(⼗)显影:
1.⼆抗孵育完后,回收,-20℃保存。1×TBST摇床上洗膜三次,每次10min。
2.⼀条⽬的蛋⽩即⼀张膜需要100ul发光液A和100ul发光液B,根据膜数计算⽤量,提前4℃混合好发光液A和B。
3.到暗室中加混合好的发光液,在胶⽚左上⾓剪⼀⼩⾓(和PVDF膜⼀致),曝光胶⽚,可分别不同时长曝光,如15s,30s,1min,5min等,然后在显影液和定影液中显影,放⼊⾃来⽔中。出暗室后,将胶⽚挂起晾⼲。
也可⽤Bio-rad凝胶成像系统照相,选择不同的曝光时间成像。
Little Trick1.需通过不同曝光时间探索某蛋⽩最佳曝光时间,多次重复实验即可采⽤此曝光时长。我最开始也是在暗室中显影,后来⽤Bio-rad凝胶成像系统照相,对⽐结果发现后者的结果更加清晰明显,背景也更加⼲净,之后就⼀直⽤成像仪曝光照相了。
2.夹取胶⽚可⽤普通镊⼦,但也只夹胶⽚左上⾓,避免损害胶⽚上曝光的蛋⽩条带。
3.胶⽚左上⾓maker⼀侧⼀定要剪⼀⼩⾓或做其它标记,才可在显影后明显对应各个样品。
4.若暗室曝光,可能内参蛋⽩发光液刚加上就出现很亮的条带,这时最长曝光15s已经⾜够。
(⼗)膜重⽣:
若显影效果不好,可将膜重⽣,再次显影,省去了配胶、电泳和电转等步骤。
1.加4ml蛋⽩印迹膜再⽣液,室温摇床30min。
2. 1×TBST洗3次,每次10min。
3.5% BSA或5%⽜奶封闭2h。
4.⼀抗4℃孵育过夜。
5.次⽇1×TBST洗三次,每次10min。
6.⼆抗孵育2h。
7.1×TBST洗三次,每次10min,曝光成像。
(本实验室使⽤的100×TBST、⼆抗和⽩印迹膜再⽣液均购⾃***公司)
但是我实验⼏次膜重⽣后的结果并不理想,所以还是乖乖从头开始做WB。

本文发布于:2024-09-21 14:38:04,感谢您对本站的认可!

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