16SrRNA测序
⼏个世纪以来，通过形态学将⽣物分类成不同的类和物种。尽管这⾜以让达尔⽂和早期⽣物学家研究某些⽣物的进化和亲缘关系，但当特性不同时，这种⽅法就变得困难。 自助式洗衣机遗传差异可以通过观察核糖体RNA ( rRNA )的某些序列来研究，因为这些序列在相同属和物种的⽣物体中是保守的，但与其他物种相⽐有所不同。16S rRNA是常⽤于区分细菌种类的rRNA序列。 功夫面
16S rRNA测序是20世纪70年代⾸次⽤于系统发育研究。随后的研究有助于巩固⽣命树的“三域”观点，其中真核⽣物、细菌和古细菌是不同的域，⽽不是以前持有的真核⽣物和原核⽣物的分裂。从那以后，它还通过重新分类和重新命名⼀些物种，以及通过鉴定不可培养和未知的细菌，帮助澄清细菌之间的关系。 聚合酶链反应( PCR )和测序设备的出现极⼤地帮助了16S rRNA的分析。价格、⽅法和技术都有所改进，使⼩型实验室和诊所更容易获得16S rRNA分析，以便进⾏细菌鉴定。实验室越来越普遍的做法是只关注⼩亚单位( SSU )序列，⽽不是进⾏完整的分析..然⽽，对于⼀些任务，例如鉴定新物种，使⽤SSU序列可能是不够的。SSU序列可以具有⾼相似性⽽不属于相同物种。尽管如此，SSU序列通常对于某些实验室⽬的是⾜够的。
使16S rRNA序列对系统发育研究如此有价值的本质是⾼变区和⾼度保守区的组合，它们相互交替。⾼变区的取代率估计是保守区的七千倍。鉴于16S基因的功能没有改变，⾼变区的差异被认为反映了时间和基因组差异的量度。 当使⽤PCR分析16S rRNA时，将通⽤引物应⽤于样品。由此产⽣的部分16S基因扩增⼦包含⾼变区，通过序列⽐对将其与其它已知序列进⾏⽐较。这⼀结果有助于推断细菌之间的系统发育关系。到⽬前为⽌，PCR本⾝的步骤，包括RNA提取、纯化、PCR扩增和序列编辑，给许多诊所带来了障碍。未来的发展⽅向是使这⼀过程⾃动化。
植物蛋白提取>手摇甘蔗榨汁机在最近的研究中，16S rRNA测序的PCR⽅法受到质疑。引物的使⽤是这⼀批评的主要焦点。PCR⽅法使⽤通⽤引物，但是通⽤引物不是绝对的。此外，PCR周期中引物退⽕不均匀会导致结果偏差。此外，这些引物检测不到不同序列的细菌的可能性更令⼈担忧。
我在真理教的⽇⼦2最近提出的解决⽅案是省略PCR和引物，⽽是使⽤下⼀代测序( NGS )平台直接测序16S rRNA。。应⽤时，这种⽅法显⽰细菌落的复杂性不同。研究⼈员初步认为，这是因为PCR⽅法消除了引物退⽕不均匀造成的偏差..希望这种新的直接⽅法能应⽤于不可培养细菌的分析。
16S rRNA的分析在研究和诊断⽅⾯具有⼀系列功能。当⽤于鉴定⽬的时，16S rRNA测序可以鉴定90 %以上的病例中难以区分的细菌属级。这在诊断环境中特别有⽤，在诊断环境中，鉴定致病细菌允许
增加对疾病病理的理解并选择正确的⽅案。16S rRNA测序分析显⽰，以前只在北美被诊断的海豚链球菌菌株，现在也在亚洲被发现。对于免疫功能低下的患者，16S rRNA测序鉴定出胎⼉弯曲杆菌菌株导致菌⾎症，并影响是否给予抗⽣素。
难以培养或不可能培养的细菌传统上难以鉴定和表征。当涉及致病细菌时，这是特别成问题的，因为细菌⽣理学知识在产⽣针对它的中是⽆价的。早在20世纪初，惠普尔⽒病的病因就不为⼈所知。通过16S rRNA测序，确定滋养体为致病细菌。这项发现也加速了⽤于诊断⽬的的分⼦测试的发展。多分力传感器
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