【篇名】 LAMMPS结合能
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【摘要】 本文首先介绍了LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)的特点,其能够模拟多种分子动力学系统,性能优越,易于扩展和优化,可以用来解算各种化学反应、物性材料、生物体系等复杂动态系统。接着,结合能的概念及其计算原理也介绍了一番。最后,结合LAMMPS模拟平台,对结合能的计算方法和步骤有了更加详细的说明。 【关键词】 LAMMPS;结合能;计算原理
频率补偿 【正文】
温度自动控制系统 1、 LAMMPS介绍
LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一个针对大规模分子动力学(MD)模拟的开源软件包,由Sandia National Laboratories开发,用于模拟多
种分子动力学系统。LAMMPS被认为是具有高性能和可扩展性的MD模拟引擎,能够模拟从单原子到固体的各种体系,广泛应用于化学反应、物性材料、生物体系等复杂动态系统的研究。
2、 结合能介绍
结合能是指两个物质之间相互作用的能量。它又称作结合能,分子间结合能,可以解释分子结构和和物性的规律变化,是理解、预测和控制分子组装结构的重要指标。LAMMPS软件包具有有效的功能,能够用来计算复杂体系中分子结合能的分子动力学仿真。
3、 LAMMPS计算结合能的步骤
(1)模型参数的设置:首先确定所要模拟的物质、分子的结构和原子成分,然后指定模拟系统的温度、压强和其他环境参数。
(2)分子动力学模拟:根据上一步确定的参数,通过LAMMPS软件进行分子动力学模拟,到系统的平衡结构,即计算吸附能量;
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(3)聚合物假定:接着,通过将和非结合分子聚合为聚合物,根据聚合物假定(PA)计算出聚合物的能量;
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贴片共模电感 (4)计算结合能:最后,出聚合物的能量减去吸附能量,就可以得到结合能,也就是系统中物质互相结合的能量。
【结论】
通过LAMMPS软件,能够进行精确的分子动力学模拟,计算出化学反应、物性材料和生物体系等复杂动态系统中的结合能。