不结球白菜(

结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis Makino)种质资源SRAP遗
传分化分析
作物ACTAAGRONOMICASINICA2007,33(11):1862—1868
ISSN0496—3490;CODENTSHPA9
/zwxb/
E-mail:*********************
不结球白菜(Brassicacampestrisssp.chinensisMakino)种质资源SRAP
遗传分化分析
韩建明,侯喜林,徐海明史公军耿建峰邓晓辉
(南京农,l大学作物遗传i种质创新旧家再点实验窜,江苏南京210095;洛阳农业科学研究院,河南洛阳471022;浙汀大学农业与生物技术学
院农学系,浙江杭州310029)
摘要:利用SRAP分子标记分析了国内外64份不结球白菜种质资源的DNA遗传多样性和遗传分化.21对引物组合
共检测出215个位点,其中112个为多态性位点,多态性比率达52.09%,平均每对引物组合产生10.24个位点和5.33个
多态性位点.不结球白菜各类型中普通白菜的Nei's基因多样性指数(0.1410)和遗传丰富度[(190)88.37%]最高;各生
态区域[fI汀淮流域不结球白菜的Nei's基因多样性指数(0.1451)和遗传丰富度[(185)86.05%]最高;国内的Nei's基因
多样性指数(0.1293)和遗传丰富度[(188)87.44%]分别高于国外.遗传变异估算表明,不结球白菜遗传分化系数
58.22%,大部分变异存在丁种问;基因流为0.4031,说明体问基因流动较少,遗传分化程度较高.以遗传相似系数
0.872为截值,口『把不结球球白菜分为Ⅵ个类.
智能楼宇可视对讲系统关键词:不结球白菜(Brassicacampestrisssp.chinensisMakino);种质资源;SRAP;遗传多样性;遗传分化
GeneticDifferentiationofNon-HeadingChineseCabbage(Brassicacampestrisssp. chinensisMakino)GermplasmBasedonSRAPMarkers
HANJian—Ming,,H0UXi—Iin,,XUHai—Ming,SHIGong—Jun,GENGJian—Feng,andDENGXiao—Hui (NationalKeyLaboratoryofCropGeneticsandGermplasmEnhancement,
Agricuhur',dSciences,Luoyang471022,Henan;DepartmentofAgronomy, NamingAgriculturalUniversity,Nanjing210095,Jiangsu;LuoyangAcademyof
Zh~iangUniversity,Hangzhou310029,Zh~iang,China)
Abstract:Thegeneticdiversityanddifferentiationwereassessedin64accessionsofnon—headingChinesecabbagefromall
thewoadbySRAP(Sequence—relatedamplifiedpolymorphism)markers.Twohundredandfifteenlociweredetectedby21 pairsofSRAPprimers.Amongthem,112werepolymorphie,thepolymorphieratewas52.09 %,and10.24loci
and5.33 polymorphielociwereamplifiedbyeachpairprimeranaverage.TheNei'sgenediversityinde xandGeneticrichnessofB.
compestrisvarmuniswere0.1410and(190)88.37%respectively,thehighestamongdif ferenttypesofnon—heading
Chinesecabbage,and0.1451and(185)86.05%respectivelyinJianghuaiPlain,thehighesta mongalltheregions
ecologicalregions.Thesetwoindiceswererespectively0.1293and(188)87.44%higherindo mesticcabbagethaninthe
fbreigncabbage.Themeasurementofgeneticvariationshowedthatthecoefficientofgene tic differentiationwas58.22%. Mostofthegeneticvariationexistedamongpopulations.Thegeneflow(0.4031)waslessamo ngpopulations,indicatingthat thedegreeofgeneticdifferentiationwashigher.Sixgroupswereclusteredaccordingtogeneti csimilaritycoefficientof0.872.
Keywords:Non—headingChinesecabbage(Brassicacampestrisssp.chinensisMakino);Germplasm;SRAP; Genetic
diversity;Geneticdifierentiation硫芥子气
不结球白菜(Brassicacampestrisssp.chinensis
Makino)原产f{1国,具有适应性广,生长期短,高
产,省工,易种,品质柔嫩,营养丰富以及鲜食腌债皆
宜等特点.不结球白菜占长江中下游各大中城市蔬
菜年总产量的30%~40%,占秋,冬,春季蔬菜复种
面积的40%~60%,在蔬菜周年生产和供应上占有
保偏光纤耦合器重要地位.近年来不仪北方大量引种栽培,东南亚,
日本,美国及欧洲一些国家也广泛引种,不结球白菜
已逐渐成为世界性的蔬菜.
种质资源是遗传改良的基础,只有了解种质资
基金项目:周家自然科学基金项目(30671420);南京农q大学作物遗传j种质创新闻家重点实验室开放课题(ZW2005007)
作者简介:韩建明(1966一),男,副研究员,主要从事蔬菜遗传育种.Tel:025—84395332;E—mail:*********************
通汛作者(Correspondingauthor):侯喜林,男,教授,博f生导师.TeI:025—84395917;E-mail:**************
Received(收稿F1期):2006—10—12;Accepted(接受日期):2006.12—19.
第11期韩建明等:不结球白菜(Brassicacampestrisssp.chinensisMakino)种质资源SRAP遗传分化分析
源遗传变异信息及亲缘关系的疏远,才能有目的地
选配亲本,培育出优良品种.目前小麦,玉米,水稻,
大豆等世界性主要作物种质资源的研究日新月
异J.巾尉作为不结球白菜遗传多样性巾心和起源
中心,曾在不结球白菜种质资源形态学,生物学特
性,分类及品质鉴定等方面进行了研究',并通过
研究其起源,构建了包括不结球白菜的中同白菜演化关系图,但利用分子标记对国内外不结球白菜
种质资源的遗传分析报道较少.
近几年,DNA分子标记被广泛应用于辅助选择
育种,遗传多样性研究,其中应用较多的有RAPD, AFLP和SSR等,RAPD方法简单,成本低,但重复性较差,检测位点不多;SSR多为共显性,重复性好,但位点较少,引物开发成本高;AFLP谱带多,但分析程序复杂,成本高.2001年Li和Quiros12]开发了一
种新型分子标记SRAP(Sequence—relatedamplified polymorphism),可通过独特的引物设计优先扩增基因组内的开放阅读框(ORF),对基因组内龠子区域, 启动子区域进行特异扩增.因不同个体,物种的内
含子,启动子及问隔区长度不同而产生多态性.该
384孔板
标记具有简便,稳定,兼有RAPD的操作简单和AFLP重复性好,多态性强的优点,目前已应用于图谱构建n,比较基因组学¨和遗传多样性分
析..本研究将SRAP分子标记应用于不结球白
菜的遗传分析,旨在了解不结球白菜的遗传背景,为不结球白菜优势利用中的亲本选配提供理论基础,以解决生产中由于少数高产品种大面积应用而使品种遗传脆弱性加剧的问题.
1材料与方法
1.1材料
为保证不同类型和地理来源的遗传代表性,从
5个国家和国内14个省(市)选取有代表性的不结
球白菜共64份,其中同内47份,国外17份;包含了普通白菜,乌塌菜,菜心(薹),分蘖菜和薹荣等类型
(表1)
表1供试材料及来源
Table1Thecodeandoriginofthematedal 编出种
O
ri
gin
Ec
olo
高温闸板阀
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odeAccession
编号
品种
O玻璃胶嘴
ri
gin
Ec
ologi

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