1. 分子标记技术及其定义
1974年,Grozdicker 等人在鉴定温度敏感表型的腺病毒DNA突变体时, 利用限制性内切酶酶解后得到的DNA片段的差异, 首创了DNA分子标记。所谓分子标记是根据基因组DNA存在丰富的多态性而发展起来的可直接反映生物个体在DNA水平上的差异的一类新型的遗传标记,它是继形态学标记、细胞学标记、生化标记之后最为可靠的遗传标记技术。广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质分子。通常所说的分子标记是指以DNA多态性为基础的遗传标记。分子标记技术本质上都是以检测生物个体在基因或基因型上所产生的变异来反映基因组之间差异。 2. 分子标记技术的类型
分子标记从它诞生之日起, 就引起了生物科学家极大的兴趣,在经历了短短几十年的迅猛发展后, 分子标记技术日趋成熟, 现已出现的分子标记技术有几十种, 部分分子标记技术所属类型如下。
2.1 建立在Southern杂交基础上的分子标记技术
(1) RFLP ( Rest rict ion Fragment Length Polymorphism) 限制性内切酶片段长度多态性标记；
(2) CISH ( Chromosome In Situ Hybridization) 染体原位杂交。
2.2 以重复序列为基础的分子标记技术
(1) ( Satellite DNA ) 卫星DNA；
(2) ( Minisatellite DNA ) 小卫星DNA;
(3) SSR( Simple Sequence Repeat ) 简单序列重复, 即微卫星DNA。
2.3 以PCR为基础的分子标记技术
(1) RAPD ( Randomly Amplif ied Polymorphic DNA ) 随机扩增多态性DNA；
(2) AFLP( Amplif ied Fragment Length Polymorphism) 扩增片段长度多态性；
(3) SSCP( Single Strand Conformation Polymorphism) 单链构象多态性；
(4) cDNA-AFLP ( cDNA- AmplifiedFragment Length Polymorphism ) cDNA - 扩增片段长度多态性；
(5) TRAP( Target Region Amplified Polymorphism) 靶位区域扩增多态性；
(6) SCAR ( Sequence Char acterized Amplified Region) 序列特征化扩增区域；
(7) SRAP ( Sequencerelated Amplified Polymorphism) 相关序列扩增多态性。
2.4 以mRNA为基础的分子标记技术
(1) ESTs( Expressed Sequence Tags) 表达序列标签；
(2) DD( Differential Dislay ) 差异显示；
(3) RT-PCR( Reverse T ranscription PCR)逆转录PCR；
(4) DDRT-PCR ( Differential Display Reverse Transcription PCR) 差异显示逆转录PCR；
(5) RAD( Representative Difference Analysis) 特征性差异分析；
(6) SAGE( Serial analysis of gene expression) 基因表达系列分析。
2.5 以单个核甘酸的变异为核心的分子标记技术
SNP( Single Nucleotide Polymorphism) 单核苷酸多态性标记。
2.6 以特定序列为核心的分子标记技术
mtDNA ( Mitochondrial DNA) 线粒体DNA分子标记。
3. 代表性分子标记技术
3.1 RFLP 限制性片段长度多态性
RFLP( Rest rict ion Fragment Length Po ly
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