专利类型：发明专利
发明人：高海东，姜传北
申请号：CN202011317707.7
申请日：20201123
公开号：CN112481387A
公开日：
20210312
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了一种基于NGS测序技术精准组装叶绿体基因组的方法，步骤如下：S1、利用illumina测序技术对样品进行测序；S2、下载NCBI数据库中所有叶绿体基因组序列构建本地参考数据库；S3、将测序数据比对步骤2构建的数据库，筛出叶绿体数据；S4、使用spades软件对步骤S3得到的数据进行初步组装，得到contigs序列；S5、将步骤S4得到的contigs序列进行自身比对，将有相似性的contigs去冗余；S6、对剩余的contigs序列挑选最长的1条进行reads比对迭代延伸，在延伸过程中将检测到有overlap的contigs进行融合，形成新的contig；本发明克服了叶绿体基因组获得周期长、难度大、不经济等问题，解决了在组装技术上不完整、不精确等问题，对叶绿体基因组的研究就有经济、高效、普适性等特点。 申请人：南京集思慧远生物科技有限公司，南京鑫普华生物科技有限公司
地址：210046 江苏省南京市栖霞区仙林街道仙林大学城纬地路9号F7栋545室
国籍：CN
豫公网安备41160202000603
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