学院始建于1971年，是中南地区创办最早的药学院。40多年来，药学院始终秉承“明德求真，弘药济世”的院训，遵循“瞄准一流，卯足干劲，敢于竞争，特发展”的办院方略，奉行“创新、实践、人文、开放”的药学人才培养理念，现已成为高层次药学专门人才培养基地，为国家输送各类药学人才8000余人。 现设有药物化学、中药与天然药物学、生物药学、药物分析学、药剂学、医药商业贸易学6个系，实验教学、分析测试2个中心。 现有教职工80人，其中教授18人、副教授36人。教师队伍中双聘院士1人、教育部长江学者讲座教授1人、特聘教授1人、国家杰出青年科学基金获得者1人，科技部中青年科技创新领军人才1人、青年千人1人、国家优秀青年科学基金获得者1人、教育部新世纪优秀人才4人；湖北省楚天学者讲座教授1人，楚天学子9人；华中科技大学学术前沿青年团队2个，华中科技大学学术新人2人，享受国务院政府特殊津贴4人。学院有国家药典委员会委员1人，中国药学会理事1人、中国药理学会理事1人，湖北省药学会副理事长1人，湖北省各专业委员会主任委员、副主任委员7人。 设有药学博士后流动站、药学一级学科博士授予点，可在药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生物技术药物学、药理学、中药与天然药物学7个二级学科点培养博士研究生。药理学为国家重点（培育）二级学科，药学为湖北省重点一级学科。
建有国家“重大新药创制”专项—武汉综合性新药研究开发技术大平台、国家纳米药物工程技术研究中心2个国家级科研平台。拥有天然药物化学与资源评价湖北省重点实验室、湖北省现代给药系统工程技术研究中心、武汉市天然药物工程中心、华中科技大学生物医药研究院等。
学院主要围绕糖尿病、恶性肿瘤、心脑血管、神经系统、免疫系统等疾病，开展先导化合物的发现与优化、新药设计、天然药物资源品质评价、药物药理及作用机制、药物的体内作用规律及动力学性质、药物新制剂以及质量控制等学科领域研究。近五年获国家“重大新药创制”专项7项，科技部863项目1项。获省级以上各类科技奖15项，专利42项，发表SCI收录论文400余篇，近三年发表影响因子大于10分论文14篇。学院为华中科技大学“药理学与毒理学”、“化学”等学科进入ESI国际排名前1%作出了重要贡献。
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