基因表达谱是指在特定条件下特定细胞的基因组中表达的所有基因的数量和类型,是观察基因表达水平和基因功能的方法之一。它涉及到许多高通量技术,例如基因芯片和RNA测序技术。这些技术为研究人类和其他生物体的分子生物学提供了深入和广泛的视野。 一、 基因表达谱分析的方法
(一)基因芯片技术
基因芯片是一组信号引线被固定在玻璃、硅或聚合物芯片上,然后在芯片上涂覆DNA探针或RNA探针。通过与样品RNA或DNA杂交,可以获得探针的信号,该信号可以反映出样品中特定基因的表达水平。基因芯片技术被广泛应用于许多领域,如肿瘤学、病毒学、发育生物学和毒理学等。其中,云芯片(CloudChip)是最近研发的一种微流控基因芯片,其具有高通量和多样性的特点,能够在同一芯片上进行DNA、RNA和蛋白质的检测。 (二)RNA测序技术
RNA测序技术涉及通过深度测序的方法。其支持高通量、全基因组范围和没有限制的RNA表达谱监测,允许了对低拷贝RNA分子的分析。此外,RNA测序技术还能够检测出RNA剪接事件、RNA修饰和全沉默RNA等。目前,Illumina、ABI/SOLiD、Roche 454和Ion Torrent等公司均提供了RNA测序的商业化服务。
二、 基因表达谱分析的应用
(一)肿瘤研究
肿瘤研究是基因表达谱最重要的应用之一,因为它可以提供基因调控和肿瘤发展过程中的信号通路信息。RNA测序分析可以揭示细胞周期、DNA修复和蛋白质降解的相关过程。同时,它也可以揭示肿瘤细胞与正常细胞的差异。
(二)发育生物学
基因表达谱分析在发育生物学方面也是非常有用的。它不仅可以分析精子和卵子的变化,还可以检测胚胎的发育过程中不同阶段的基因表达。基因芯片技术可以用来研究胚胎发育过程中启动和关闭基因的调节,并确定哪些基因在生物发育的关键时期中发挥着最为重要
的作用。
(三)制药行业
基因表达谱分析在药物开发中也是非常有用的。例如,它可以用来发现一些在药物研发过程中被忽视的靶点基因,并且能够确定药物作用的生理学目标。研究表明,只有25%的新药与都有确定的生理学目标。
(四)生物工程
基因表达谱分析可以用于识别有用的生物分子,这些分子在基因工程、酵母工程和微生物学方面是非常重要的。通过基因表达谱分析可以发现哪些基因对于生产实际价值的化合物有重要的贡献,以及如何去操纵这些基因以提高产量。
总之,基因表达谱分析技术的宽广和多面,使它成为了当前分子生物学领域的一个重要方法。除了目前已经被广泛应用的肿瘤研究、发育生物学、制药行业和生物工程等领域以外,在很多其他的领域如代谢物分析、环境检测、人类遗传学等领域也都有着广泛的应用。相信,在不久的将来,基因表达谱分析技术将更加完善和成熟,为我们的生命科学研
究提供更多更深刻的知识。