2生物技术通报BiotechnologyBulletin2010年第8期
征是富含甘氨酸和苯丙氨酸残基的C—X。川一C—X。一。一 C—X,一H。分析的结果表明含有C—X,一。-C・X,一C—X,-H
克氏锥虫基序的CCCH蛋白是最大的一个类,约占75%,
并认为该基序很可能是其它CCCH基序的一个
起源。
目前,关于CCCH结构的研究主要是CCCH与
RNA复合体的结构。Hudson等"1已经利用核磁共
振技术得到了TISllD的CCCH结构域与富含AU
图3Atc3H“的RNA复合物的三维结构
TISllD与拟南芥中AtC3H14都含有两个连续的C-
X8.c.x5.c.x3.H基序,并且两个基序之间的氨基酸
残基的间隔都是18个,其它的残基的保守性也很
高。Wang依据前者模拟了AtC3H14与RNA结合
的三维构象(图3,图4)。
圈1TISllD与RNA单体结合的三维结构图2TISllD与RNA单体结合的拓扑结构
圈4AtC3H14结构的分子接触表面拓扑结构
WangHl根据图l一图4分析,每个CCCH锌指的N端都有一段KTEL(V)的残基,这段残基形成与RNA结合的关键接触面,每个锌指都形成一个容纳RNA的口袋,分别容纳RNA的u6和U2两个核苷酸残基。U2一Phe293-A3,U4-Tyr287一U5,U6一Phe
255.A7和U8一Tyr249.U9相互之间形成的芳香族的堆积力在CCCH锌指结构与RNA结合中起着关键作用,这些相应的氨基酸的缺失可能会导致二者的结合丧失紧密性。
3.1组织表达
在植物中,Wang等在拟南芥和水稻中分别鉴定到68个和67个CCCH基因,这些CCCH在不同的组织中都有表达,但CCCH基因的组织表达模式不同。根据表达模式的差异可以将CCCH基因分为3类。第一类的基因在所有4种检测的组织
都有表达,这类基因在拟南芥中有33个,在水稻