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在自然界里,水草原生的原生地“河川或湖泊”，时时都有新的水流入,水草利用水中含有的 CO2，及从太阳光的能量来行光合作用;根从土壤中吸收由微生物分解的有机物,另外叶子从水中吸收营养素,如此可有效抑制河川及湖泊的营养化。还有自然界中有无数的原生动物和微生物存在,可将有机物、浮游物有效分解,而净化了水质，如前所述,自然界本身就有一个平衡的生态系,具备水质净化的系统. 但是在水族箱来说,是一个完全封闭的世界，不具备自然界良好的条件,因此在之中种植水草,非得人为添加CO2设置,多的灯光及完整的过滤设备不可。在此之中过滤装置于有限的水量，扮演一个维持平稳生态系重要角。
如果鱼缸中的鱼及草的数量少时，其实使用何种过滤效果都差不多，但一般水草缸都希望有密植的水草,尤其是较矮的水草更需要有充足的光量,因此必须有充分置放灯具的空间，另外水草也需要充足CO2,故溶入水中的CO2要尽量避免逸散，根据以上的需求来定出过滤器所需的条件:
1、 有充分放置照明设备的空间;<
2、 CO2不易逸散、
3、 维持长期的高过滤能力。野战光缆
现流行的几种过滤设备进行对比
一、 上部过滤
因设置于鱼缸上部，照明设备所能放置的空间减少（特别是萤光灯具），如果水草密植要考虑到光量不足的现象，在过滤器的构造上,水通过过滤槽时会与空气接触,如此CＯ2也会随之逸散到空气中
优点:
1、 因为是装置在鱼缸上部,故在清洁保养上非常方便
2、 在构造上容易将CO2逸散，对于养鱼来说非常适合。<
缺点:
1、 在构造上CO2与空气接触面积大，易逸散掉；、
2、 在照明设备的放置空间会受限,不适合水草的培育。
二、 底部过滤
底部过滤底床内会产生水流,使水中与底床几乎无温度差，另外又能补充底床氧气,对于水草 而言,理论上是很适合，但是水的净化是利用底砂作为过滤器，水必须通过砂的间隙,而水草的根也是利用砂的间隙成长，如果水草长的非常茂密时根的丛生也是必然，因而砂粒间水的通路变少,过滤的效果会随之降低,故用于希望长期维持的水景是不适用的
优点
1、 底床内会产生水流，底床与水中的温度差变小；<
2、 可供应底床微生物较多的氧气，有益微生物繁衍。＜
缺点：
1、 底床面水草生长茂盛时,草根易将砂隙阻塞，故不易长期维持水质稳定
单列调心滚子轴承2、 底肥易流失，在水草缸不适合使用。<
三、 内部过滤
因设置于鱼缸内部,因此过滤槽不会太大，过滤能力会受限，还有在观瞻上也有影响
优点：
1、 有充分放置照明设备的空间；<
2、 CO２不易逸散;
3、 底床也没问题，又有水流,符合种植水草的条件。
缺点：＜肥皂生产设备
1、 设置于鱼缸内部，水草栽种空间受限；
2、 会影响到整体的美观。
四、 外部过滤桶
1、 可于鱼缸上部充分设置照明设备；
2、 水草生长所需ＣO2不易逸散;
3、 过滤槽的能力较强
缺点：
水温易受外面气温影响。
以上三个优点刚好符合上述水草需要条件,故水草缸以密闭式外部过滤为最适合。<
滤材的介绍
使用密闭式外部过滤,在过滤桶内会有许多滤材,滤材本身大约具备“物理过滤”、“化学过滤”和“生物过滤”三种功能
物理过滤 主要是使用网状物，及羊毛,将水中较大的杂物除去。
化学过滤 利用活性碳吸附,除去导致水混浊的有机物及鱼的排泄物.
生物过滤 利用在滤材表面所繁衍的微生物，或原生动物的活动来过滤,培养有益微生物正
常生长，需要花一些时间，同时也要有适当的环境，过滤效果的好坏，几乎都取决于生物过滤的能力。要发挥最大的过滤功能,就必须将上述三种功能作最佳组合
生物过滤的功能
单单只靠物理过滤及化学过滤，并无法将污水中所含阿摩尼亚及细菌除去,因此要靠附着在滤材表面的有益微生物(分为需要氧气的好氧性微生物及不须氧气的厌氧性微生物)，及原生动物来净化，以下就好氧性、厌氧性微生物及原生动物的功用作说明:排火
好氧性微生物
可将污水中的浮游物和有机物分解,另外会将有毒性的阿摩尼亚转换为亚硝酸,甚至可成为完全没有毒性的硝酸（硝化菌的硝化作用)
厌氧性微生物
可将好氧性微生物酸化作用所产生的硝酸性氮气，分解为氮气瓦斯、碳酸瓦斯等来达到净化水质的效果。
原生动物
除有效微生物外，另外尚须存在有效原生动物，将会引起鱼病的细菌类捕食。 因此在一个健全的生物过滤的水草缸,鱼只不易生病。
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