TCGA_HM450甲基化分析位置查方法

翻边Infinium Human Methylation 450数据,官方下载,文件名为: Human Methylation 450_15017482_ v1-2 ,表内详细列出了所有检测位点的详细信息。
钛雷查某CG位点在基因序列的中的位置,直接使用Forward Sequence中的序列搜索即可,如:g蛋CTGGAGAGGCACTGAAGTGTTGCAATAGCATGGCTGGCCTTAAGTCCCGAAGTCAGAACC[CG]ACTTCCTGAAATGAGTCCTTGGTTTCATCAGGTTCAAGTGCTTTGTTTTTAGATAAAAAC,序列表明了CG的位置(中括号内)。至于基因全序列,可以在NCBI或者UCSC查,但都应设置包含启动子上游2000bp以上的序列。
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