总RNA提取,cDNA第一条链合成,cDNA纯化,3‘端加尾实验,荧光定量PCRprotocol

RNA Extraction Protocol
1.实验原理
塑料袋泳衣
异硫氰酸胍/苯酚法-----目前实验室使用的方法!
细胞在变性剂异硫氰酸胍的作用下被裂解,同时核蛋白体上的蛋白变性,核酸释放 auts
释放出来的DNA和RNA由于在特定pH下溶解度的不同而分别位于整个体系中的中间相和水相,从而得以分离
2.实验试剂与器材
玻璃钢拍门>电化学传感器2.1实验试剂
RNA提取试剂Trizol(Invitrogen)、氯仿、异丙醇、75%乙醇、无水乙醇、DEPC水,反转录试剂盒(Fermentas),cDNA纯化试剂盒(Promega),末端加尾酶TdT(Thermo)。
2.2实验器材
微量移液器(Eppendorf),电泳仪,电泳槽,超净工作台,4℃低温离心机(Eppendorf),常温离心机(Eppendorf),匀浆机(IKA),高压蒸汽灭菌锅,通风橱,紫外分光光度计(Eppendorf),PCR仪(Takala),剪刀,镊子,0.2mL、1.5mL离心管,头。
3.实验前准备工作
实验前将要用到的试剂配好(75%乙醇:75mL的无水乙醇+25mL的去离子水;DEPC水:在1000ml双蒸水中加入DEPC原液1ml,然后摇匀过夜),与离心管、头、剪刀、镊子(用DEPC水处理过的,浸泡过夜)一起灭菌(126℃,90min),之后剪刀和镊子最好在紫外灯下照射半小时。提前20min打开低温离心机预冷。准备两幅手套,一个口罩,塑胶手套不能离开通风橱,整个实验过程尽量降低外源RNA酶对样品中RNA的降解。
4.实验步骤手术台
4.1取样
(1)组织样品:将组织在RNA保护液中用剪刀剪碎,每50~100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。
(2)贴壁培养细胞:不须消化,直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即3.5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。TRIzol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。TRIzol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。
(3)细胞悬液:300~500g离心10min收集细胞,每5~10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1mlTRIzol,反复吸打。加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。
4.2 RNA提取
(1)匀浆:取50~100mg保存在-80°C或保存在RNA保护液(RNAfixer,百泰克生物公司)中的组织加入800μl Trizol充分匀浆(匀浆机调到4或者5档,一次5s,一共2~3次。匀浆的时候不要贴着管壁,尽量减少泡沫的产生),每次匀浆完一个样品要用沾有75%酒精的纸擦拭匀浆机的钻头。
(2)裂解:加入200μl Trizol,充分剧烈震荡15s,在冰上静置5min;4℃,12000g,离心10min。
(3)分离:将离心后的上清液转移到另一离心管,加入250μl氯仿(动作要快,氯仿见光分解),剧烈震荡30s,室温放置3min;4℃,12000g,离心15min。
(4)沉淀:将离心后的上清液转移到另一离心管(注:切记不要吸到中下层溶液,宁可少吸一些上清),加入500μl预冷的异丙醇(提前在冰上放置),上下颠倒混匀,于-20℃放置15min;4℃,12000g,离心10min,弃异丙醇上清,收集沉淀。
(5)洗盐:在收集的沉淀中加入1ml的75%乙醇(预冷,无RNase,优级纯,RNA提取专用),上下颠倒混匀(4~5次);4℃,12000g,离心5min,吸出75%乙醇弃去,留下沉淀。
(6)保存:在沉淀中加入1ml无水乙醇,保存于-80℃(一般最多可以保存1个月)。
(7)取出3~5μg(芝麻粒大小)保存于无水乙醇中的RNA,加入30μl DEPC水中,取2μlRNA 用于琼脂糖凝胶电泳检测其完整性。
(8)取2μlRNA用紫外分光光度计检测其定位板A260值、A260/A280值。纯净的RNA的A260/A280应在1.8~2.2之间。

本文发布于:2024-09-21 17:58:50,感谢您对本站的认可!

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