(完整版)RNA提取及反转录合成cDNA具体实验步骤

RNA提取及反转录合成cDNA具体实验步骤
由杨盛于2011/6/8 12:56 创建
一、RNA提取前的准备
RNA制备的关键是要抑制细胞中的RNA分解和防止所用器具及试剂中的RNA 分解酶的污染。因此,在实验中必须采取以下措施:
1、戴一次性手套;
2、使用RNA操作专用实验台;
3、在操作过程中避免讲话等。
通过以上办法可以防止实验者的汗液、唾液中的RNA分解酶的污染。
二、使用器具
尽量使用一次性塑料器皿,若用玻璃器皿,应在使用前按下列方法进行处理:
1、用0.1%DEPC水溶液在37℃下处理12小时,
2、然后在120℃下高温灭菌30min以除去残留的DEPC,
(RNA实验用的器具建议专门使用,不要用于其他实验。)
三、试剂配制
用于RNA实验的试剂,须使用干热灭菌(180℃,60min)或使用上述方法进行DEPC水处理灭菌后的玻璃容器盛装(也可以使用RNA实验用的一次性塑料容器),使用的无菌水需用0.1%的DEPC处理后再进行高温高压灭菌。
RNA实验用的试剂和无菌水都应专用,避免混用后交叉污染。
四、实验操作
研磨样品前,先把所要用到的试剂和头、研钵(未拆开报纸)放在超净工
红外线烘干作台上,打开紫外灯照射20-30min杀菌。
1. 50-100mg的普通组织样品:RNAiso Plus 1ml
2. 试验样品的研磨和匀浆
防震床(1)将超低温冻结的RNA提取样品称量后迅速转移至用液氮预冷的研钵中,用研钵研磨组织,其间不断加入液氮,直至研磨成粉末状(无明显的
课件颗粒,如果没有研磨彻底会影响RNA的收率和质量)。(研磨好的
样品立即加入RNAiso Plus)
(2)对于普通的RNA提取样品,可以向研钵中加入适量的RNAiso Plus,将研磨成粉末状的样品完全覆盖,然后室温静置,直至样品完全融化,
再用研杵继续研磨至裂解液呈透明状。
(3)将匀浆液转移至离心管中,室温静置5min。
(4)12000g 4℃离心5min。
(5)小心吸取上清液,移入新的离心管中(切勿吸取沉淀)。
3.Total RNA 的提取
(加入RNAiso Plus 后,静置5min,离心转移上清,避免未破碎的杂蛋白污染)
(1)向上述步骤2的匀浆裂解液中加入氯仿(RNAiso Plus 的1/5体积量),盖紧离心管盖,用手剧烈振荡15s(氯仿沸点低,易挥发,振荡时应小心
任一农
离心管突然弹开)。待溶液充分乳化(无分相现象)后,再室温静置5min。(2)12000 g 4℃离心15min。
(3)从离心机中小心取出离心管,此时匀浆液分为三层:无的上清液、中间的白蛋白层及带颜的下层有机相。吸取上清液转移至另一新的
离心管中(切忌吸出白中间层)。
(4)向上清中加入等体积的异丙醇,上下颠倒离心管充分混匀后,在15-30℃下静置10min。
(5)12000g 4 ℃离心10min。一般在离心后,试管底部会出现沉淀。
4.RNA沉淀的清洗
小心弃去上清,缓慢的沿离心管壁加入75%的乙醇(用DEPC-Water配制)1ml(切勿触及沉淀),轻轻上下颠倒洗涤离心管壁,12000g 4℃离心5min后小心弃去乙醇(为了更好的控制RNA中的盐离子含量,应尽量除净乙醇)。
伸缩车棚
仿兔毛纱线5.RNA的溶解
室温干燥沉淀2-5min(不可以离心或加热干燥,否则RNA将会很难溶解,有关RNA溶解可以参考Troubleshooting中的相关说明),加入适量的
Rnase-free水溶解沉淀,必要时可以用移液抢轻轻吹打沉淀,待RNA沉淀完全溶解后于-80℃保存。(提取的RNA立即进行反转录,确保RNA不降解,剩余的RNA标记好放到旁边-80℃冰箱保存。)
PCR扩增
1.反转录反应
(1)在Microtube管中配制下列混合液
Dntp Mixture(10Mm each)1ul
Oligo Dt Primer (2.5uM)1ul
Total RNA5ul
Rnase Free dH2O Up to 10 ul
(2) 在PCR仪上进行变性、退火反应。
65℃5min
4℃
(说明:变性、退火操作有利于模板RNA的变性以及反转录引物和模板
的特异性退火,可提高反转录反应效率)
(3) 离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底中。
(4) 在上述Microtube管中配制下列反转录反应液
上述变性、退火后的反应液10ul
5×PrimeScript TM Buffer4ul
Rnase Inhibitor (40U/ul)0.5ul
PrimeScript TM Rtase (for 2 Step)0.5ul
Rnase Free Dh2O5ul
Total Volume20ul
(反转录的体系做成40ul)
(5) 在PCR仪上按下列条件进行反转录反应
42-50℃15-30min
95℃5min直接染料
4℃
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本文发布于:2024-09-22 19:20:18,感谢您对本站的认可!

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