RNA逆转录
实验器材: PCR管,去RNA酶头,PCR仪,掌上离心机及振荡器
试剂:DEPC水,逆转录试剂盒(本实验室使用兰博利德First-strand cDNA Synthesis Mix With gDNA Remover试剂盒,货号F三相混合步进电机0201)
点胶机密封圈
实验步骤:
将模板RNA在冰上解冻;LabScript RT Mix、2×RT Reaction Mix(With Primer)、gDNA Remover、5×gDNA Remover Reaction Mix、DEPC-ddH2O在室温(15-25℃)解冻,解冻后迅速置于冰上。使用前将每种溶液涡旋振荡混匀,简短离心以收集残留在管壁的液体。以下操作步骤请在冰上进行。为了保证反应液配制的准确性,进行各项反应时,应先配制成Mix,然后再分装到每个反应管中。 1.去除RNA中基因组DNA残留:食品安全检测试纸
组分 | 体积 |
RNA模板 | ≤ 1 µg total RNA 或≤ 0.1 µg poly(A) mRNA |
5×gDNA Remover Reaction Mix | 1.6 µl |
gDNA Remover | 0.5 µl |
DEPC-ddH2O | 补足至8 µl |
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混匀,并短暂离心,反应条件为 37℃,5 min。
2.在上述的反应管中,直接添加如下的反转录反应所需组分,进行第一链 cDNA 的合成步骤: 组分 | 水平面体积 |
gDNA Remover处理后RNA样品 | 8 µl |
2×RT Reaction Mix(With Primer) | 10 µl |
LabScript RT Mix | 1 µl |
DEPC-ddH2O | 补足至20 µl qam调制器 |
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3.轻轻混匀,短暂离心;42℃孵育 15-30 min。
4.85℃加热 5 min 失活 LabScript RT Mix。
5.反应结束后所得的 cDNA,请置于冰上进行后续实验或冷冻保存。
注意事项:
1.实验过程中请注意避免 RNase 污染。
2.除酶以外的各种试剂,使用之前请完全溶解并充分混匀,以防因盐离子浓度不均影响实验结果。
3.RNA 模板的完整性对 cDNA 合成效率起着决定性作用,因此请选择可靠的RNA提取/纯化方法。
4.捕鱼网具由于所有的 RNA 提取方法都不能完全去除基因组 DNA,所以应根据后续实验的需求, 选择是否需要在反转录反应前去除残留基因组 DNA。本产品中的 gDNA remover 组分,只需 5 min 即可除高效去基因组 DNA。
5.LabScript RT Mix 合成的第一链 cDNA 产物可直接加入 PCR 反应混合物中进行扩增,但加入体积不应超过PCR反应总体系的 10%,否则可能影响目的片段的产量。PCR 扩增使用的耐热 DNA 聚合酶和热循环条件需要根据目的片段的大小、GC含量、引物特性、以及对保真度的要求等进行选择。
6.第一链 cDNA 合成产物经过处理后可作为第二链合成的模板,合成含各种标记的cDNA,
作为杂交实验的探针。
RNA 可置于-80℃以下长期保存,cDNA 合成产物可置于-20℃保存。