cDNA文库构建简易流程

电极材料1、紫茎泽兰第一链cDNA的合成
万寿菊粉  取2 u1提取的紫茎泽兰mRNA,加入适量的CDSIII  primer和SMART  IV Oligo寡
核苷酸以及其它相应试剂,在适当的条件下,经反转录酶进行反转录合成紫茎泽兰第一链cDNA.
2、LD-PCR合成紫茎泽兰第二链cDNA
    取合成的紫茎泽兰第一链cDNA加入其它试剂,通过LD-PCR进行双链cDNA的合成
3、紫茎泽兰双链cDNA的酶切及分离纯化
卡孔双链cDNA经蛋白酶K消化去除DNA聚合酶活性,经氯仿:异戊醇抽提,酒精沉淀后,用限制性内切酶sfi I进行酶切消化。 酶切后,过CHROMA SPIN-400柱进行分级分离纯化,以去除小的片段和杂质,依次收集16管,经1. 0%的琼脂糖凝胶电泳检测后,收集cDNA含量最高的几管。
4、双链cDNA片段的克隆和体外包装
分级分离纯化的双链cDNA,定向克隆到试剂盒提供的经sfi I酶切的去磷酸化的入λTripIEx2载体上,在载体量不变的前提下,设定了3个连接梯度反应,连接结束后,3个连接产物分别用Promega公司的Packagene Lambda DNA受Packaging System包装,体外包装条件按试剂盒说明进行。
5、文库的滴定与重组率检测
用常规方法检查文库的滴度。3个连接反应包装后,分别取1ul用1X Lambda dilution buffer按1:10稀释,稀释后的入噬菌体裂解物再分别取0. 5ul 加入到150ul预先过夜培养的XL1-BLue菌液,在37 C进行20min的吸附后,再加入到1. 5m1熔化的LB/MgSO4顶层软琼脂,迅速混匀倒到预热至37℃的平板上,快速摇动平板使顶层软琼脂分布均匀,顶层软琼脂凝固后在37℃培养箱中倒置培养,每相隔一段时间后,检查噬菌斑生长情况。根据长成的噬菌斑的数目进行文库的滴度计算,公式如下
图像拼接器: 免拆模板   
14n
文库的重组率则利用蓝白斑互选进行,在每1. 5m1的顶层琼脂加入50ul X-gal (20mg/ml) , 50ul IPTG (200mg/Ml),待噬菌斑长成后,统计蓝白斑的数量,算出重组率。
6、 cDNA的PCR快速鉴定
从平皿中直接挑取噬菌斑,用5' PCR primer和3' PCR primer分别进行PCR扩增检查插入片段的长度。
初步结果:按l : 10的比例稀释后滴定,过夜后统计噬菌斑数目并计算滴度。1号和2号连接反应的噬菌斑很少,滴度很低,而3号连接反应的滴度为2.47X106pfu/ml, 滴度很高,符合建库标准。所以3号连接反应的cDNA与载体的比例最理想,连接效率最高。
紫茎泽兰cDNA的PCR快速鉴定,随机挑取10个透明噬菌斑,PCR扩增均有大于
500bp的插入片段,进一步说明已成功获得了紫茎泽兰cDNA重组噬菌体。

本文发布于:2024-09-22 01:56:15,感谢您对本站的认可!

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