看专家玩转circRNA:高分文章、面上项目两不缺

看专家玩转circRNA：高分文章、面上项目两不缺

circRNA之前一直以为是基因错误转录的结果。

“在2013年，Jeck WR在《RNA》发文提出circRNA发生的两种模型：套索驱动环化；内含子配对驱动环化。

外显子跳跃导致套索限制性结构促进环化。而反向剪接则通过上子互补序列能促进其环化，并受到特异性蛋白因子调节。并且

游剪接体受体跟下游剪接体供体配对，也可导致RNA环化。另外外显circRNA会参与很多生物学进程。所以circRNA不是简单的错误剪接。”

在非编码领域，miRNA相关中标基金项目依旧非常多；其次是受到广泛重视的lncRNA，在今年有超过420项；circRNA则像一个新星，正冉冉升起，今年有超过140项受到了国自然的资助，很多人在没有占到lncRNA的红利情况，转头开始研究circRNA（国自然基金结合“申请思路”的热点梳理）。

近期著名循环学杂志Circulation发表了复旦大学五官科医院颜标教授与赵晨教授为共同通讯作者的文章，报道了环状RNA circHIPK3在糖尿病视网膜血管功能障碍中的作用。

心脏病，心血管方向的顶级期刊。

Circulation今年（2016版）的其最新的影响因子为19.3，属于该文报道糖尿病引起的视网膜血管功能障碍中circHIPK3（hsa_circ_0000284）显著升高，研究表明circHIPK3可以竞争性结合miR-30a，调控VEGFC、 FZD4和WNT2基因，在糖尿病引起视网膜血管功能障碍中发挥作用。

1、circHIPK3的筛选

circHIPK3在人脐静脉内皮细胞中异常表达（上调），通过circBase发现HIPK3基因可以编码20个环状RNA。

4个人属2个小鼠的circRNAs在各自的视网膜内皮细胞中被检测到。然后用核糖核酸酶R处理这些转录本，随后检测到2个人属circRNAs和1个小鼠circRNA表达无明显差异，证明它们是环状的转录本。最后，作者选择了保守的circHIPK3作为后续研究。

2、circHIPK3功能研究

这部分内容就属于常规套路了。通过干扰和过表达circHIPK3，检测细胞的增殖与侵袭表型变化。

3、机制研究

验证circHIPK3定位于胞质；StarBase预测circHIPK3与miR-30a存在结合位点，通过萤光素酶报告基因实验验证circHIPK3与miRNA-30a结合；下游，通过TargetScan预测，miR-30a与VEGFC、FZD4、WNT2的mRNA存在结合位点，通过实验证实，并验证miR-30a调控下游VEGFC、FZD4、WNT2基因的表达。最后验证这条circHIPK3/miR-30a/VEGFC、FZD4、WNT2在视网膜血管功能障碍中的作用。

颜标教授：

2013年命中了一项lncRNA相关研究的国自然青年项目：长链非编码RNA-RNCR3调控新生血管生成的分子机制研究

2014年命中了一项lncRNA相关研究的国自然面上项目：长链非编码RNA-MALAT1靶向Slit2-Robo4信号调控糖尿病性微血管内屏障损伤的机制研究长链非编码RNA-RNCR3调控新生血管生成的分子

机制研究

2017年命中了一项circRNA相关研究的国自然面上项目：环状RNA-cZNF532介导的周细胞与内皮细胞crosstalk在糖尿病视网膜血管病变中的作用及机制研究

可以看出，颜标教授之前就是从事非编码RNA研究的，已经从lncRNA转向circRNA方向了。

对比自己，感觉人家的人生都是开了挂的

这里，我们再看一下，此文的另一个通讯作者，赵晨教授：

2012年命中了一项mRNA相关研究的国自然面上项目

Pre-mRNA剪切缺陷引发视网膜素变性的遗传背景和机制研究

2013年命中了一项国自然面上项目

遗传性眼底病

2016年命中了一项miRNA相关研究的国自然面上项目

miR-184在干性年龄相关性黄斑变性的发病机制研究

2017年命中了一项国自然重点项目

年龄相关性黄斑变性的原发病变和继发致盲的发病机制和干预新策略

受到了暴击~~国自然项目前赴后继，连年不缺

circRNA应该是一个不错的方向，大家可以多多关注。

Ref：

1 Circular RNAs are abundant, conserved, and associated

with ALU repeats.

2 （工具篇）S4E26:环状RNA常用数据库介绍总结

3 几篇综述带你迅速入门环状RNA研究

4 环状RNA作为ceRNA研究套路总结

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